蛋白组学、代谢组学~你“嗑”的科研CP是哪对?
2022.2.22百年一天的“有爱日”
今天超多糖可以“嗑”
祝愿天下有情人终成眷属
在一年中最有爱的日子
在这充满仪式感的一天
鹿明生物CP款“网红”产品来打卡，快来看看吧~
欢迎各位老师在文末留言（念）
CP1
4D蛋白组+双平台全谱代谢组
全新4D-DIA+4D-PRM蛋白组和GC-MS&LC-MS双平台代谢组学技术组合，可以更好的从多个维度提高信息的全面性和准确性，挖掘到更多更精准的信息，从而能产出更多有价值的结果，便于后续深入的研究与应用。
研究策略：
1. 通过对蛋白组和代谢组两个分子层次的组学数据进行整合分析，可以结合两个组学的分析结果，进行相互验证，提高后续实验验证成功率；
2. 通过蛋白组和代谢组进行优势互补，并且使研究更加系统。最终实现对生物变化大趋势与方向的综合了解，提出分子生物学变化机制模型；
3. 筛选出重点代谢通路相关的蛋白质或者代谢产物，从而为后续进行深入实验与分析提供数据基础。
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CP2
16s微生物测序+全谱代谢组双平台
微生物组测序 （主要指 16S 扩增子测序与宏基因组测序） 可提供肠道细菌构成、基因丰度和功能性信息，可以解决「who is there？」（那儿有谁） 和「what are they doing？」（在干嘛） 的问题。
而代谢组学是研究生物体中代谢产物变化的科学，常用研究方法包括LC/MS（液质联用）和GC/MS（气质联用），可以解决「what have really happened？」（究竟发生了啥） 的问题。
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“有爱cp组”案例展示
英文标题：Improvement in sperm quality and spermatogenesis following faecal microbiota transplantation from alginate oligosaccharide dosed mice
中文标题：移植褐藻寡糖喂养小鼠的粪便微生物群可提升精子的质量和生成量
发表期刊：Gut
影响因子：17.943
合作单位：中国农业科学院动物科学研究所&青岛农业大学
主要技术手段：16S微生物多样性、LC-MS非靶向代谢组（由欧易/鹿明生物提供技术支持）
研究背景：多囊卵巢综合征（PCOS）患者的FMT导致卵巢功能紊乱和生育能力下降，提示肠道微生物群的改变可能是PCOS治疗的一个有价值的途径。在高脂肪饮食下形成的肠道微生物的FMT进入正常饮食的小鼠体内，导致精子无法产生且活力降低，这表明恢复肠道微生物群可能是改善由环境因素引起的男性不育障碍的一种手段。然而，到目前为止，还没有任何报告提到FMT后生育率的改善。
CP技术实验设计
参考文献：Zhang, Pengfei , et al. "Improvement in sperm quality and spermatogenesis following faecal microbiota transplantation from alginate oligosaccharide dosed mice." Gut (2020):gutjnl-2020-320992.
CP3
定量蛋白质组+修饰蛋白组
随着定量蛋白质组与磷酸化蛋白质组关联分析在癌症发病机制和精准治疗、拟南芥生长发育调控机制等研究领域发表了大量CNS级高水平文章，定量蛋白质组与修饰蛋白质组作为新晋“黄金搭档”助力更深入的调控和分子机制研究，可以多维度高深度解析生物反应机制，更精准定位主导调控作用更系统深入地揭示生命活动调节机制和规律。
服务优势
1.仪器平台升级：采用4D-tims-TOF-Pro质谱仪，提高定量的准确性、鉴定深度，鉴定数量
2.使用值得信赖的CST原厂抗体等进行肤段富集，保证实验结果
3.关联分析深度挖掘调控和分子机制
4.激酶分析、激酶-底物分析及互作网络关系分析
5.系统深入研究：从蛋白表达量和修饰层面对生物学问题进行更全面的解析
6.一站式服务：蛋白组+磷酸化蛋白组联合分析及后期PRM验证，以及多组学联合分析
7.采用4D-DIA/LFQ技术
研究案例
英文标题：Integrative Proteomic Characterization of Human Lung Adenocarcinoma
中文标题：人肺腺癌的综合蛋白组学特征
实验材料：肺腺癌肺组织
影响因子：38.637
发表期刊：Cell
研究结论：
该研究对103例LUAD患者进行了蛋白质组学综合分析。蛋白质组、磷酸化蛋白质组、转录组和整个外显子组测序数据的综合分析揭示了癌症相关的特征。基于蛋白质组学对LUAD分型，显示了三个亚型（S-I、S-II和S-III），它们与不同的临床和分子特征有关。此外，研究者发现了潜在的药物靶点，并在一个独立队列中验证了血浆中HSP9β的水平可作为LUAD的潜在预后生物标志物。本次的综合蛋白质组学分析能够更全面地了解LUAD，并为更精确的诊断和治疗提供机会。
其他参考文献
[1] Mass-spectrometry-based draft of the Arabidopsis proteome. Nature 2020.
[2] Proteogenomics of Non-smoking Lung Cancer in East Asia Delineates Molecular Signatures of Pathogenesis and
Progression. Cell 2020.
[3] Circadian rhythms in the absence of the clock gene Bmal1. Science 2020.
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