欢迎光临散文网 会员登陆 & 注册

R可视化——曼哈顿图

2022-07-28 08:49 作者:科研那点事儿  | 我要投稿

曼哈顿图(Manhattan plot)是一种GWAS分析中常用的展示基因组数据的散点图。今天,小编就带大家看一下如何使用R语言中的qqman、CMplot及ggplot2三个包绘制曼哈顿图。

基于qqman包绘制

1、安装、加载R包

2、数据

图片


3、绘图

图片


基于CMplot包绘制

1、安装、加载包

2、数据

图片


3、绘图

图片
图片
图片
图片
图片
图片
图片
图片


基于ggplot2包进行绘制

1、安装、加载包

2、数据及其处理

图片


3、绘图

图片

参考:

1)https://blog.csdn.net/ddxygq/article/details/103555955

2)https://mp.weixin.qq.com/s/IO5rqz8sXaYD5vc5EbkkPw

R可视化——曼哈顿图的评论 (共 条)

分享到微博请遵守国家法律