蛋白检测的鸟枪法

鸟枪法（Shotgun）是一种基于“自下而上”策略的蛋白质质谱分析技术，它通过直接分析蛋白肽段进而实现对完整蛋白的分析，所以称之为“自下而上”。进行鸟枪法蛋白质组学分析，首先要将完整蛋白质酶解消化为小分子肽段，然后利用质谱法检测经液相色谱分离后的肽段，根据肽段母离子的质谱数据如质荷比、离子峰强度等实现蛋白质的多种分析。鸟枪法策略采用数据依赖型模式尽可能的采集所有肽段母离子的碎片信息，可以尽可能多的鉴定样品中的全部蛋白质，是一种高通量的蛋白质分析技术，可同时鉴定成百上千种蛋白质。常见的Label Free、SILAC、TMT和iTRAQ等蛋白质定量技术都是基于鸟枪法进行的。