蛋白胶打质谱前处理

质谱技术是蛋白质组学的重要研究手段，在蛋白质研究中扮演着举足轻重的作用，其通过检测蛋白质水解后的肽段或完整蛋白质样品的质荷比等质谱信息可以实现多种分析，如蛋白质分子质量、种类、含量、结构、氨基酸序列以及翻译后修饰情况等。质谱技术可以对各种不同来源的蛋白质进行检测，包括蛋白质提取物、蛋白电泳胶条/胶点以及Pull down或Co-IP获得的蛋白样品等。

对电泳过后的蛋白质胶条这类特殊的蛋白质样品进行质谱分析，需要注意胶条大小、胶条蛋白质含量、以及胶条样品染色等方面：

（1）胶条大小：以1cm*1cm大小为宜，过大的体积容易导致酶解不充分，可以将较大的胶条分为多份进行酶解，保证酶解效率；

（2）胶条蛋白质含量：应保证单条蛋白质胶条中包含的蛋白质不低于20μg，如果通过电泳分离纯化后的蛋白条带，建议纯化前的蛋白质含量不低于5mg；

（3）胶条样本染色：考马斯亮蓝染色、SYPRO Ruby 以及银染的蛋白质胶条都可以进行质谱分析，但是需要强调的是银染过程应采取与后续质谱分析兼容的试验方法。