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揭秘医学大类组织|空间代谢组物质检出一览及切片攻略放送

2023-04-18 11:56 作者:鹿明生物  | 我要投稿

鹿明生物【一作讲座】组蛋白磷酸化响应激素信号调控肝脏糖异生的分子机制

 

空间代谢组学(Spatial Metabolomics)结合了质谱成像(Mass Spectrometry Imaging, MSI)和代谢组学,利用离子源直接扫描生物样品成像,不仅可以鉴定成千上万种代谢物的结构和相对含量,还可以在同一张组织切片上同时分析大量代谢物的空间分布特征,为传统代谢组学分析提供了全新的可视化视角,实现对代谢物进行定性、定量、定位三个维度的深入分析。


本文核心内容:

空间代谢组学在切片过程中需要注意哪些事项?

空间代谢组学检测不同类型样本的物质检出情况如何?

首先,好的数据结果离不开前期的实验处理。对于空间代谢组学的数据来说,其中成败的关键一定离不开切片,线上的研究资料中很少详细对空间代谢组切片的关注,鹿明生物经过多年的空间代谢组学研究经验,梳理了部分切片攻略,接下来具体看看吧。

1空间代谢组学切片实验具体流程

step1. 样本核对

step2. 样本固定及安装

step3. 样本修片

step4. 确认切面

step5. 正式样本收集

step6. 切片检查核对

2切片技巧和注意事项

3空间代谢组学在各类型组织中检出的物质大类占比

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的脑组织代谢物主要包含有:5-羟色胺、乙酰胆碱、GABA、多巴胺、组氨、褪黑激素等,运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定脑组织中大类物质的检出占比,如下图所示:

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的肝脏组织中代谢物主要有ATP、正磷酸盐、D-葡萄糖、草酰琥珀酸盐等,运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定肝脏组织中大类物质的检出占比,如下图所示:

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的肾脏组织中代谢物主要有N-乙酰组胺、磷酸丝氨酸、肌苷、果糖基赖氨酸等,运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定肾脏组织中大类物质的检出占比,如下图所示:

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的肿瘤组织中代谢物主要有天冬氨酸、脯氨酸、次黄嘌呤、腺嘌呤等,运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定中肿瘤组织中大类物质的检出占比,如下图所示:

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的肺组织中代谢物主要有L-乳酸、D-葡糖糖、水杨酸、柠檬酸盐等,运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定中组织中大类物质的检出占比,如下图所示:

鹿明生物AFADESI空间代谢组学常测定出的心脏组织中代谢物主要有D-葡糖糖、熊果苷、草酰琥珀酸盐、D-阿洛糖等,运用鹿明生物空间代谢组学数据库鉴定中心脏组织中大类物质的检出占比,如下图所示:

本期内容就到这了,鹿明生物提供优质的空间代谢组服务,更多关于空间代谢组学的技术交流,欢迎大家在下方互动留言哦~


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本文系鹿明生物原创

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