耐药研究福利来啦！浙大团队发布全球首个综合耐药性数据库DRESIS，一起进来看！
广泛的耐药性已经成为全球卫生保健的关键问题，其中肿瘤耐药也一直是国自然热门课题，所以一些整理耐药信息的数据库应运而生···
目前已经开发了一些耐药相关数据库，但都是针对某些疾病类别，比如癌症（如CancerDR和KinaseMD）、病毒感染（如Stanford HIV数据库和HBVdb）、细菌感染（如CARD和MEGARes）以及真菌感染（如MARDy）。然而，出现耐药性的疾病远不止癌症/感染，所以迫切需要建立一个涵盖各种疾病类别和不同类型的机制的综合性耐药数据库。
科研的终极目标就是应用，浙大朱峰教授团队在Nucleic Acids Research上发布了全球首个综合耐药性数据库DRESIS。
p 数据库概况
DRESIS作为全球首个综合耐药性数据库，首次系统地提供了所有六种类型的耐药分子机制，覆盖了现有数据库中最广泛的疾病，并描述了超过20000种药物的临床/实验验证的耐药数据。
DRESIS数据库包含6种耐药分子机制：
i. 药物治疗靶点的异常(ADTT)
ii. 药物摄取和药物排出的不规则(IDUE)
iii. 结构修饰导致的药物失活(DISM)
iv. DNA、RNA和蛋白质的表观遗传改变(EADR)
v. 促生存途径的异常激活(UAPP)
vi. 疾病微环境的调节(RTDM)
p 数据库收录信息
数据库收录了超过20 000种具有临床/实验验证耐药性信息的药物（包括816个FDA批准的药物、336种临床前/临床试验药物和19675种研究药物），对应395种耐药疾病（其中有232种(58.7%)属于癌症或感染），以及2197个关键耐药分子的分子机制，并分析了耐药相关分子的疾病特异性和组织特异性。
p 数据库检索结果展示
1) 药物的耐药性信息的详细描述
数据库系统地提供了每种药物的耐药性信息的详细描述，以化疗药物“多柔比星”为例，主要信息包括：药物名称、药物同义词、疾病适应症(以及药物的相应临床状态)、药物结构(可下载2D和3D格式)、药物靶点，与其他分子生物学数据库的外部链接（如PubChem），以及已报告对该药物具有耐药性的疾病列表。
3) 药物耐药机制信息
DRESIS中绘制了一个交互式图表以展示药物、疾病和机制之间的相互作用。药物被放置在中间，并被各种类型的机制所包围，各种疾病类别与每种机制类型相关联，而每种机制类型又与关键的抗性分子相关联。以“多柔比星”为例，交互图显示它有六种耐药机制，在每个机制下显示相应的抗性疾病，并为相应的疾病提供关键的抗性分子。
此外，数据库也可以根据疾病类别分类的药物的详细耐药机制，提供了关键耐药分子、耐药证据类型和实验细节的数据。共鉴定出2197个关键耐药分子，针对关键耐药分子，描述了它们在耐药疾病中的变化，以及不同类型的耐药证据(临床报告，由体内模型验证或由细胞系实验确定)。还提供了各种实验细节，包括多样化的实验技术、数百种疾病细胞系和感染性菌株、数百种体内模型以及在耐药疾病中被调节的各种信号通路。
3) 针对特定疾病的耐药药物的全景图
数据库提供针对特定疾病的药物和关键耐药分子的综合列表。以“乳腺癌”为例，在纵轴上使用药物id提供了耐药药物的完整列表，在横轴上使用相应的分子id显示了关键耐药分子列表。由于乳腺癌(以及许多其他疾病)中涉及大量药物和关键分子，DRESIS通过拖动图中所示交互图底部和右侧的滑块，实现了整个全景的可视化图。图中用不同颜色的圆圈(中间有字母“R”)表示了不同类型的抗性机制，将鼠标放在任意一个圆圈上，可以交互查看机制类型、耐药药物和关键分子的详细信息。
除了全景图之外，详细的耐药机制也在DRESIS的疾病网页中有明确的描述，包括关键分子的数据、耐药性证据的类型和实验细节，信息与第2步中一致。
4) 耐药分子的疾病/组织特异性丰度
DRESIS提供了关键抗性分子的疾病和组织特异性表达丰度。基于TCGA和GTEx数据库分析了疾病患者和健康个体之间这些关键抗性ncRNAs的丰度差异，以小提琴图形式展示。基于GEO和GTEx数据库分析不同组织之间关键抗性分子的组织特异性丰度变化，以柱状图形式展示。
p 数据下载
用户可以从数据库“Download”页面免费下载数据库完整数据。
参考文献
Sun X, Zhang Y, Li H, et al. DRESIS: the first comprehensive landscape of drug resistance information. Nucleic Acids Res. 2023;51(D1):D1263-D1275. doi:10.1093/nar/gkac812
小云之声
本次数据库的介绍就分享到这里了，关注耐药方向的小伙伴可以尝试使用下数据库哦！
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