欢迎光临散文网 会员登陆 & 注册

育种遗传参数评估与全基因组选择究竟在讲什么?

2023-04-03 14:30 作者:vsnc软件  | 我要投稿

随着大数据育种时代的来临,如何高效地分析育种数据,准确地进行遗传评估对育种工作者来说至关重要。对于不同的数据,如何选择合适的模型,如何进行基因组选择分析,如何计算育种值和近交系数,如何选种选配等内容都是育种单位迫切需求的知识,通过本次培训,您可以得到一套完整的解决方案。

ASReml软件是国际知名的遗传评估软件,专门用于海量数据的混合模型分析,并可估算许多重要的遗传参数。新版本ASReml-R V4和ASReml-SA更适合大数据的基因组选择分析,计算效率高,模型丰富,操作简单,在国际上应用广泛。

核心和亮点

※ 内容涵盖数量遗传学常见模型:半同胞全同胞模型、个体动物模型、单性状模型、多性状模型、阈值性状模型等;

※ 高效育种实战模块:包括批量处理单性状模型、批量计算遗传相关和表型相关、计算遗传进展和综合育种值等;

※ GWAS分析模块:本次培训将使用最新的免费R包ASRgwas,处理二分类性状的广义混合线性模型(GLMM),支持多个随机因子,考虑显性模型和上位模型,功能强大,结果可靠;

※ 基因组选择模块:单性状GBLUP和一步法,多性状GBLUP和一步法,rrBLUP和贝叶斯方法,结果形式包括模型评价和交叉验证等。


详细内容

一、R语言与数量遗传学

 R语言及R包安装配置

 读取数据和清洗数据

 数据汇总统计和建模分析

 数量遗传学基础与混合线性模型介绍

 半同胞全同胞模型

 动物模型(Animalmodel)

 计算遗传力及标准误

 计算BLUP的准确性和可靠性


二、数量遗传学常用模型

  重复力模型分析  

  窝别效应模型分析

  母体效应模型分析  

  阈值性状模型分析


三、数量遗传学进阶模型

  环境相关(TypeB相关)

 连续和连续性状模型分析

 阈值和连续性状模型分析

 阈值和阈值性状模型分析


四、育种数据分析高效实战  

 批量计算单性状模型

 批量计算遗传相关和表型相关

 如何计算综合育种值和遗传进展


五、全基因组选择(GWAS)

 GWAS原理介绍及数据分析

 ASRgwas软件包实战

 连续性状GWAS分析及可视化

 阈值性状GWAS分析及可视化


六、全基因组选择(GS)

 全基因组选择介绍

 基因型数据清洗

 对基因型数据可视化:PCA和热图

 如何构建A矩阵,G矩阵及H矩阵

 GS模型:单性状GBLUP和多性状GBLUP

 GS模型:单性状ssGBLUP和多性状ssGBLUP

 交叉验证及模型评价

 rrBLUP和贝叶斯方法演示


看一下有没有您所感兴趣的内容?你也想进行育种遗传参数评估和全基因组选择分析么?那不妨学习以上内容。

俗话说工欲善其事必先利其器,赶快加入学习队伍吧!

育种遗传参数评估与全基因组选择究竟在讲什么?的评论 (共 条)

分享到微博请遵守国家法律