实操指南| 如何快速解锁植物样品CUT&Tag实验？
Cleavage Under Target & Tagmentation (CUT&Tag)是一种新兴的研究DNA-蛋白质互作的方法。
2019年，Steven Henikoff团队将该技术首次应用于哺乳动物细胞，在《Nature Communications》上公布。该方法克服了传统ChIP-Seq技术的很多缺点，省时，操作简便，数据信噪比高，需要的细胞起始量低。
除了动物组织，细胞样品，该项技术在植物领域也越来越受到大家的关注和青睐。研发人员对CUT&Tag技术进行改进，打破植物细胞壁、大液泡和次生代谢产物的壁垒，使其能够广泛应用于植物染色质的释放。目前已在棉花，水稻，拟南芥的植物样品中取得成功；
案例一：
Efficient chromatin profiling of H3K4me3 modification in cotton using CUT&Tag
发表单位：浙江大学关雪莹团队
文献来源：DOI: 10.1186/s13007-020-00664-8
实验样品：棉花
抽提细胞核流程图
Tips：
1.如果样品少，可以不进行过滤操作；
2.抽提完细胞核后，可以无缝衔接CUT&Tag Assay Kit (pAG-Tn5) for Illumina (RK20265);
试剂配方:
Nuclear isolation buffer A (10 mM Tris pH 8.0, 10 mM KCl, 0.5 mM spermidine)50 mL for one sample;
Nuclear isolation buffer B (10 mM Tris pH 8.0, 10 mM KCl, 0.5 mM spermidine, 0.5% Triton X-100, 0.1% cocktail) ;
Nuclear wash buffer (10 mM Tris pH 8.0, 150 mM NaCl, 0.5 mM spermidine, protease inhibitor cocktail 0.1%).
案例二：
Rapid and Low-Input Profiling of Histone Marks in Plants Using Nucleus CUT&Tag
发表单位：华中农业大学李兴旺课题组
文献来源：DOI:10.3389/ fpls.2021.634679
实验样品：单子叶植物水稻和双子叶植物油菜籽
Formaldehyde-fixed nuclei (Zhao et al., 2020)，doi: 10.1038/s41467-020-16457-5 ；
The native nuclei from fresh tissue (Sun et al., 2020),doi: 10.1186/s13059-020- 02063-7 ;
Tips：
1、Buffer S (50 mM HEPES-KOH (pH7.5), 150 mM NaCl, 1 mM Ethylene Diamine Tetra-acetic Acid (EDTA), 1%Triton X-100, 0.1%sodium deoxycholate, 1%SDS)
2、水稻，油菜可以将样品量减少到0.1
or 0.01 g ；
3、抽提完细胞核后，可以无缝衔接CUT&Tag Assay Kit (pAG-Tn5) for Illumina (RK20265);
ABclonal（爱博泰克）推出了基于pAG-Tn5的CUT&Tag解决方案，为蛋白-DNA互作研究提供了有利的工具，并成功在1000个拟南芥细胞核样品中富集H3K4me3靶标基因（图1）。
同时，针对不同需求的客户群体，推出了灵活可选择的产品套餐。包括CUT&Tag试剂盒,转座体,单酶,以及经过验证的CUT&Tag抗体（ABclonal自产抗体）。
图1拟南芥根细胞核CUT&Tag实验结果（Peak IGV图）
ABclonal
公司简介
爱博泰克生物科技有限公司（ABclonal Technology Co.,Ltd.）成立于2011年，作为生命科学解决方案的提供商，旨在为更多的科研工作者、IVD企业、新技术开发企业提供抗体、酶、NGS产品和蛋白制品等全套解决方案。
