autodock 01-分子对接软件安装-10分钟

Autodock vina分子对接软件的安装

安装须知：

I.                    软件都为英文软件，因此大家下载后将软件安装包放入英文目录下。例如：D:\vina。因为一旦有中文目录的话，有的软件会出现问题，尤其是MGLTools-1.5.6。

II.                  我所提供的软件都要安装。

1、安装画结构软件ChemBioOffice 2014。主要应用其组件ChemBiodraw（用于画小分子化合物的结构）和Chembio3D（将小分子化合物的2维平面结构转换为3维立体结构）。安装目录C盘或D盘都可以。在01_ChemBioOffice 2014文件夹里为大家录制了ChemBioOffice 2010的安装视频，与ChemBioOffice 2014安装方法一样的。

2、安装显示软件和结果分析PyMoL 1.7.2.1。根据你的系统，选择02_PyMoL_1.7.2.1_(32位)或02_PyMoL_1.7.2.1_(64位)安装。

首先安装python-2.7（在pymol的压缩包里找），默认安装目录C: \Python27，为pymol软件提供语言环境。然后安装显示软PyMoL 1.7.2.1。默认安装目录自动到：C: \Python27\PyMOL

3、安装对接主程序Autodock Vina 1.1.2。找到程序03_autodock_vina_1_1_2_win32.msi，直接安装在目录： 安装目录D:\Program Files\The Scripps Research Institute\Vina\vina.exe

4、安装辅助软件AutoDock Tools，即MGLTools-1.5.6。找到程序04_mgltools_win32_1.5.6.exe，安装目录D:\Program Files\MGLTools 1.5.6\

5、在05_分子对接脚本文件夹里有脚本1.0-Docking.bat和vina的配制文件conf.txt。

以蛋白3DLG为例，进行讲解。下载地址：http://www.rcsb.org/

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