GraphBio：一款开源免费的模块可拓展组学数据可视化软件（支持私有定制部署）
最近，我们注意到一些公司和高校拓展和集成了GraphBio，比如：
迪安诊断：yushiny.shinyapps.io/DAV_v1/
北大一实验室：
http://www.fynn-guo.cn:3838/MOIomicsplotting/
看来大家对GraphBio还挺喜欢，毕竟被R社区评为生命科学领域内7个最好的R shiny dashboard之一嘛。
因此，为了让大家能够更方便的部署到自己web服务器，做一些定制化修改（因为是模块化设计，拓展操作非常简单方便），方便自己的用户使用。我们现在把docker版本发布出来，供大家轻松私有部署，请大家没有任何顾虑的随意使用和分发。
docker pull databio2022/graphbio:v2.2.7-manualdocker run --rm -d -p 80:3838 -v /root/log/:/home/shiny/graphbio-log/ databio2022/graphbio:v2.2.7-manual /init
For english version, please use:docker pull databio2022/graphbio:v2.2.5-en-manualdocker run --rm -d -p 80:3838 -v /root/log/:/home/shiny/graphbio-log/ databio2022/graphbio:v2.2.5-en-manual /init
有些朋友可能还不知道GraphBio是什么，下面由ChatGPT做个简要介绍：GraphBio是一个先进且用户友好的R Shiny Web应用程序，旨在简化组学数据的可视化和分析过程。无论您是生物学家、遗传学家还是研究人员，处理基因组、转录组或蛋白组数据，GraphBio都能提供模块化和可扩展的解决方案，让您轻松进行流行的可视化分析。
GraphBio提供了每个功能的示例数据文件，用户只需要按照示例文件数据格式，上传即可完成可视化。以下是一些示例文件的介绍：
热图：heatmap_test.csv和group_info.csv
火山图：volcano_example.csv和volcano_example1.csv
累积分布曲线：cdc_example.csv和cdc-mutiple-group.csv
弦图：chord_example.csv
网络图：corr_net.csv
相关散点图：corr_scatter.csv
GO富集图（样式2）：go_bubble_example.csv
GO富集图（样式1）：go_term_bubble.csv
MA图：ma_example.csv
饼图：pie_example.csv
ROC曲线：roc_example.csv
四象限图：sixiangxian_example.csv
生存曲线：surv_example.csv
聚类分析：text_cluster_example.csv
Venn图：venn_example.csv
网站请访问 http://www.graphbio1.com/
源码和示例文件请访问 https://github.com/databio2022/GraphBio
引用： Zhao T and Wang Z (2022), GraphBio: A shiny web app to easily perform popular visualization analysis for omics data. Front. Genet. 13:957317.doi: 10.3389/fgene.2022.957317
