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自噬研究指南|最“冷门”的自噬——微自噬系列介绍(二)

2023-09-08 16:58 作者:小恒学术  | 我要投稿

上期我们主要介绍了微线粒体自噬和内吞体微自噬,本期将继续介绍其他选择性微自噬。在正式介绍之前,先复习一下这张选择性微自噬示意图吧,以便更好地理解本期内容~

图1 哺乳动物中选择性微自噬通路[1]

a. 微线粒体自噬;b.微内质网自噬;c.微细胞核自噬;d.微溶酶体自噬;e.微脂质体自噬;f.内吞体微自噬;g.微蛋白质自噬

 

微内质网自噬

指内质网直接与溶酶体融合并降解。目前在哺乳动物中,已发现了三种微内质网自噬形式。

1. ERES(ER exit site)微自噬:成骨细胞中,前胶原亚群与一些自噬标志物(如LC3)和泛素识别基因(如p62,也称为SQSTM1)形成微粒,随后被运送至溶酶体内进行降解,这一过程依赖于ER出口位点(ERES)的形成,被称为“ERES微自噬”[2]。

2. ERLAD(ER-to-lysosome-associated degradation):SERPINA1的Z变体编码一种蛋白酶体抗性形式的α1-抗胰蛋白酶(ATZ),当其被包装在内质网来源的单膜囊泡内时会递送到溶酶体中,通过“内质网到溶酶体相关降解(ERLAD)”的过程降解[3]。这一过程包括两个连续的阶段:内质网来源的小泡的形成和内质网来源的小泡与溶酶体融合降解。

3. 碎片微内质网自噬(piecemeal microreticulophagy)[4]:指将内质网子结构域递送至溶酶体中,这个过程由LC3脂质化介导。在急性内质网应激后的恢复期,易位基因SEC62通过LC3相互作用区域(LIR)将脂质化的LC3招募到内质网子结构域上,最后包含内质网子结构域的囊泡被递送至溶酶体进行降解。这一过程对内质网从应激状态中恢复具有重要意义。

机体如何确定选择哪种形式进行微内质网自噬的机制尚不明确,科学家认为这可能是由不同的上游信号通路决定的。

 

微细胞核自噬

指通过溶酶体途径选择性降解细胞核成分。有研究[5]报道关键的DNA传感器环GMP-AMP酶(cGAS)可以被募集到微核中与LC3相互作用促进核成分降解,但这一过程指向大自噬还是微自噬还未有定论。

微细胞核自噬的有一种特殊形式被称为RN/ DNautophagy[6],通过溶酶体相关膜蛋白2C (LAMP2C)和SID1跨膜家族成员2(SIDT2)将RNA和DNA摄取到溶酶体中进行降解。由于细胞RNA和DNA越来越多地被认为是固有免疫的介质,因此越来越多的研究人员开始关注RN/DNautophagy,研究其在疾病中的作用。

 

微溶酶体自噬

指受损的溶酶体与健康的溶酶体融合并降解,这对于调节溶酶体的体积和功能非常重要。在处于葡萄糖饥饿状态或使用l-亮氨酸-l-亮氨酸甲酯(溶酶体损伤剂)处理的细胞中,溶酶体脂化LC3促进溶酶体内腔内囊泡的形成,选择性降解溶酶体膜蛋白[7]。

当LC3脂质化出现缺陷时,环指蛋白152(RNF152)和溶酶体相关跨膜蛋白4A(LAPTM4A)通过溶酶体以泛素和escrt(转运所需的内体分选复合体)依赖的方式快速降解,从而实现微溶酶体自噬[8]。

 

微脂质体自噬

指脂质直接被转运至溶酶体中降解。近年有一项研究[9]表明小鼠肝细胞在营养不足条件下会发生微脂质体自噬。在没有ATG蛋白(或自噬体)和溶酶体相关跨膜蛋白2A(LAMP2A)的情况下,溶酶体和脂滴(LD)相互作用,直接将LD转运至溶酶体中。此外,在转运至溶酶体之前,体积较大的LD会在细胞溶质脂肪酶的作用下缩小体积,这表明了一种碎片化的微脂噬机制。

 

微蛋白自噬

指通过溶酶体或空泡降解特定蛋白质。在哺乳动物细胞中,微蛋白自噬示例(图2)。在氨基酸饥饿的早期阶段,多种自噬受体通过ESCRT-Ⅲ或VPS4(III型磷脂酰肌醇激酶,细胞自噬过程中的一种关键蛋白)途径被溶酶体降解。丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶ULK2可被非典型蛋白激酶Cλ/ι亚型(PRKCI)磷酸化,促进其泛素化在VPS4的作用下被溶酶体降解[10]。一些自噬受体,如SQSTM1和CALCOCO2,在ATG7和ATG12-ATG5-ATG16L1复合物以及脂质化LC3/ATG8的作用下,通过ESCRT转运至溶酶体中降解。

此外,WNT信号通路也可诱导微蛋白自噬[11]。胞质蛋白被蛋白质精氨酸甲基转移酶1 (PRMT1)甲基化(Me),PRMT1促进糖原合成酶激酶3(GSK3)的磷酸化和多种泛素连接酶(E3)的多泛素化,在WNT信号通路的调控下GSK3通过ESCRT转运至溶酶体中降解。

 

 

图2微蛋白自噬图示[1]

 

至此,所有类型的选择性微自噬已介绍完毕,下期是“微自噬系列”的最后一期,感兴趣的小伙伴可以留意一下哦~

 

 

参考文献

[1]Wang, Liming., Klionsky, Daniel J., Shen, Han-Ming., Shen, Han-Ming.. The emerging mechanisms and functions of microautophagy. Nature reviews. Molecular cell biology, 2022, .

[2]Omari, Shakib., Makareeva, Elena., Roberts-Pilgrim, Anna., Mirigian, Lynn., Jarnik, Michal..  Noncanonical autophagy at ER exit sites regulates procollagen turnover. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115(43):E10099-E10108.

[3]Fregno, Ilaria., Fregno, Ilaria., Fasana, Elisa., Bergmann, Timothy J., Bergmann, Timothy J..  ER-to-lysosome-associated degradation of proteasome-resistant ATZ polymers occurs via receptor-mediated vesicular transport. The EMBO journal, 2018, 37(17).

[4]Loi, Marisa., Loi, Marisa., Raimondi, Andrea., Morone, Diego., Molinari, Maurizio..  ESCRT-III-driven piecemeal micro-ER-phagy remodels the ER during recovery from ER stress. Nature communications, 2019, 10(1):5058.

[5]Zhao, Mengmeng., Zhao, Mengmeng., Wang, Fei., Wang, Fei., Wu, Juehui.. CGAS is a micronucleophagy receptor for the clearance of micronuclei. Autophagy, 2021, 17(12):3976-3991.

[6]Fujiwara, Yuuki., Furuta, Akiko., Kikuchi, Hisae., Aizawa, Shu., Hatanaka, Yusuke..  Discovery of a novel type of autophagy targeting RNA. Autophagy, 2013, 9(3).

[7]Lee, Chan., Lamech, Lilian., Johns, Eleanor., Overholtzer, Michael.. Selective Lysosome Membrane Turnover Is Induced by Nutrient Starvation. Developmental cell, 2020, 55(3):289-297.e4.

[8]Zhang, Weichao., Yang, Xi., Chen, Liang., Liu, Yun-Yu., Venkatarangan, Varsha..  A  conserved ubiquitin- and ESCRT-dependent pathway internalizes human lysosomal membrane proteins for degradation. PLoS biology, 2021, 19(7).

[9]Schulze, Ryan J., Schulze, Ryan J., Krueger, Eugene W., Krueger, Eugene W., Weller, Shaun G..  Direct lysosome-based autophagy of lipid droplets in hepatocytes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2020, 117(51):32443-32452.

[10]Mejlvang, Jakob., Olsvik, Hallvard., Svenning, Steingrim., Bruun, Jack-Ansgar., Abudu, Yakubu Princely.. Starvation induces rapid degradation of selective autophagy receptors by endosomal microautophagy. The Journal of cell biology, 2018, 217(10):3640-3655.

[11]Albrecht, Lauren V., Albrecht, Lauren V., Ploper, Diego., Ploper, Diego., Tejeda-Muñoz, Nydia.. Arginine methylation is required for canonical Wnt signaling and endolysosomal trafficking. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America, 2018, 115(23):E5317-E5325.


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