凝胶阻滞(实验简介,实验步骤)
一,凝胶阻滞实验简介:
※ 凝胶阻滞实验是通过检测质粒的结合能力以及脂质体,进而达到影响转染效率的结果。该实验一般应用于研究蛋白质的DNA以及蛋白质RNA的相互作用,在实验对照泳道过程中(不含蛋白质的DNA / RNA探针)将通过条带进而显现出来结果。
二,凝胶阻滞实验所需材料及试剂:
10ul白吸头(灭菌) ,0.5ml尖底连盖离心管 ,Agarose,过硫酸铵,丙烯酰胺
三,凝胶阻滞实验步骤:
1.聚丙烯酰胺凝胶的制备
(1)将干净的夹具,配板和垫片组装。用胶带密封侧面和底部(防止凝胶漏出)
(2)聚丙烯酰胺凝胶5%的制备步骤:
产品名称体积:MediumH2O78毫升39毫升10×TBE 5毫升2.5毫升30%丙烯酰胺(19:1)16.6 毫升8.4 毫升10%过硫酸铵1000 微升500 微升
(3)充分混合以减少泡沫的形成,加入10%的琼脂糖,100微升 / 50微升TEMED。
(4)混合后,将其倒入橡胶片中并插入梳子,约15分钟胶体凝固。
(5)凝固后,可以将凝胶包裹在塑料膜中放在4℃环境下保存。
2.准备5X结合缓冲液。
3.组合反应:
① 1微升poly-dIdC(1微克/微升)
② 2μl5x结合缓冲液
③ 1 微升标记探针+0.1微升100xBSA
⑤ 加入体积(微升)核提取物(总蛋白5ug)
⑥ 将H2O添加到10 微升总体积中
⑦ 加入适量抗体(使阻滞更加明显),在室温下30min。
4.在结合反应性自由基的过程中,将凝胶安装到电泳槽中,在150伏的0.5×TBE电泳缓冲液中预运行30min,然后在150 V的电压下加载样品和电泳2小时。
5.制作干胶(可选):将胶转移到滤纸上。用胶水覆盖滤纸,并在80°C的真空干燥机中干燥1-2小时。
6.在暗室中挤压并曝光胶卷,并将胶卷放入暗盒中,暴露于-80°C。