生物化学名词解释 第二章
1,构形(configuration):有机分子中各个原子特有的固定的空间排列。这种排
列不经过共价键的断裂和重新形成是不会改变的。构形的改变往往使分子的光
学活性发生变化。
2,构象(conformation):指一个分子中,不改变共价键结构,仅单键周围的原
子放置所产生的空间排布。一种构象改变为另一种构象时,不要求共价键的断
裂和重新形成。构象改变不会改变分子的光学活性。
3,肽单位(peptide unit):又称为肽基(peptide group),是肽键主链上的重
复结构。是由参于肽链形成的氮原子,碳原子和它们的 4 个取代成分:羰基氧
原子,酰氨氢原子和两个相邻α-碳原子组成的一个平面单位。
4,蛋白质二级结构(protein 在蛋白质分子中的局布区域内氨基酸残基的有规
则的排列。常见的有二级结构有α-螺旋和β-折叠。二级结构是通过骨架上的羰
基和酰胺基团之间形成的氢键维持的。
5,蛋白质三级结构(protein tertiary structure): 蛋白质分子处于它的天然折
叠状态的三维构象。三级结构是在二级结构的基础上进一步盘绕,折叠形成
的。三级结构主要是靠氨基酸侧链之间的疏水相互作用,氢键,范德华力和盐
键维持的。
6,蛋白质四级结构(protein quaternary structure):多亚基蛋白质的三维结
构。实际上是具有三级结构多肽(亚基)以适当方式聚合所呈现的三维结构。
7,α-螺旋(α-heliv):蛋白质中常见的二级结构,肽链主链绕假想的中心轴盘
绕成螺旋状,一般都是右手螺旋结构,螺旋是靠链内氢键维持的。每个氨基酸
残基(第 n 个)的羰基与多肽链 C 端方向的第 4 个残基(第 4+n 个)的酰胺氮
形成氢键。在古典的右手α-螺旋结构中,螺距为 0.54nm,每一圈含有 3.6 个氨
基酸残基,每个残基沿着螺旋的长轴上升 0.15nm. 8, β-折叠(β-sheet): 蛋白
质中常见的二级结构,是由伸展的多肽链组成的。折叠片的构象是通过一个肽键
的羰基氧和位于同一个肽链的另一个酰氨氢之间形成的氢键维持的。氢键几乎
都垂直伸展的肽链,这些肽链可以是平行排列(由 N 到 C 方向)或者是反平行
排列(肽链反向排列)。
9,β-转角(β-turn):也是多肽链中常见的二级结构,是连接蛋白质分子中的二
级结构(α-螺旋和β-折叠),使肽链走向改变的一种非重复多肽区,一般含有 2~
16 个氨基酸残基。含有 5 个以上的氨基酸残基的转角又常称为环(loop)。常
见的转角含有 4 个氨基酸残基有两种类型:转角 I 的特点是:第一个氨基酸残
基羰基氧与第四个残基的酰氨氮之间形成氢键;转角Ⅱ的第三个残基往往是甘
氨酸。这两种转角中的第二个残侉大都是脯氨酸。
10,超二级结构(super-secondary structure):也称为基元(motif).在蛋白质
中,特别是球蛋白中,经常可以看到由若干相邻的二级结构单元组合在一起,
彼此相互作用,形成有规则的,在空间上能辨认的二级结构组合体。
11,结构域(domain):在蛋白质的三级结构内的独立折叠单元。结构域通常
都是几个超二级结构单元的组合。
12,纤维蛋白(fibrous protein):一类主要的不溶于水的蛋白质,通常都含有
呈现相同二级结构的多肽链许多纤维蛋白结合紧密,并为 单个细胞或整个生物
体提供机械强度,起着保护或结构上的作用。
13,球蛋白(globular protein):紧凑的,近似球形的,含有折叠紧密的多肽链的
一类蛋白质,许多都溶于水。典形的球蛋白含有能特异的识别其它化合物的凹
陷或裂隙部位。
14,角蛋白(keratin):由处于α-螺旋或β-折叠构象的平行的多肽链组成不溶于水
的起着保护或结构作用蛋白质。
15,胶原(蛋白)(collagen):是动物结缔组织最丰富的一种蛋白质,它是由原
胶原蛋白分子组成。原胶原蛋白是一种具有右手超螺旋结构的蛋白。每个原胶
原分子都是由 3 条特殊的左手螺旋(螺距 0.95nm,每一圈含有 3.3 个残基)的
多肽链右手旋转形成的。
16,疏水相互作用(hydrophobic interaction):非极性分子之间的一种弱的非共
价的相互作用。这些非极性的分子在水相环境中具有避开水而相互聚集的倾向。
17,伴娘蛋白(chaperone):与一种新合成的多肽链形成复合物并协助它正确
折叠成具有生物功能构向的蛋白质。伴娘蛋白可以防止不正确折叠中间体的形
成和没有组装的蛋白亚基的不正确聚集,协助多肽链跨膜转运以及大的多亚基
蛋白质的组装和解体。
18,二硫键(disulfide bond):通过两个(半胱氨酸)巯基的氧化形成的共价
键。二硫键在稳定某些蛋白的三维结构上起着重要的作用。
19,范德华力(van der Waals force):中性原子之间通过瞬间静电相互作用产
生的一弱的分子之间的力。当两个原子之间的距离为它们范德华力半径之和
时,范德华力最强。强的范德华力的排斥作用可防止原子相互靠近。
20,蛋白质变性(denaturation):生物大分子的天然构象遭到破坏导致其生物
活性丧失的现象。蛋白质在受到光照,热,有机溶济以及一些变性济的作用
时,次级键受到破坏,导致天然构象的破坏,使蛋白质的生物活性丧失。
21,肌红蛋白(myoglobin):是由一条肽链和一个血红素辅基组成的结合蛋
白,是肌肉内储存氧的蛋白质,它的氧饱和曲线为双曲线型。
22,复性(renaturation):在一定的条件下,变性的生物大分子恢复成具有生
物活性的天然构象的现象。
23,波尔效应(Bohr effect):CO2 浓度的增加降低细胞内的 pH,引起红细胞
内血红蛋白氧亲和力下降的现象。
24,血红蛋白(hemoglobin): 是由含有血红素辅基的 4 个亚基组成的结合蛋
白。血红蛋白负责将氧由肺运输到外周组织,它的氧饱和曲线为 S 型。
25,别构效应(allosteric effect):又称为变构效应,是寡聚蛋白与配基结合改变
蛋白质的构象,导致蛋白质生物活性丧失的现象。
26,镰刀型细胞贫血病(sickle-cell anemia): 血红蛋白分子遗传缺陷造成的
一种疾病,病人的大部分红细胞呈镰刀状。其特点是病人的血红蛋白β—亚基 N
端的第六个氨基酸残缺是缬氨酸(vol),而不是下正常的谷氨酸残基(Ghe)。