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病原微生物检测王炸产品

2022-02-10 10:16 作者:分子科普小feng子  | 我要投稿

目前针对临床感染的明确病原多达26000多种,包含细菌、真菌、病毒、寄生虫、支原体和衣原体、分歧杆菌等,对于一些病情危重或者病因不明、特殊类型病原、外科术后感染可能性高等的患者,采用mNGS检测技术,是一种不依赖于传统微生物培养,无偏好性的病原检测技术。通过直接对临床样本中的核酸进行高通量测序,然后与数据库进行比对分析,根据比对到的序列信息来判断样本包含的病原微生物种类,能够快速、客观的检测临床样本中的较多病原微生物(包括病毒、细菌、真菌、寄生虫),且无需特异性扩增,尤其适用于急危重症和疑难感染的诊断。

样本的类型多种多样,通过感染的部位进行采样,例如脑脊液、肺穿刺、痰液、拭子、肺泡灌洗液、血液等等,部分类型的样本需要看DNA和RNA的全部数据,尤其是含有人类宿主类型的样本为了避免数据的浪费以及后续的结果分析,会去除人和细菌的rRNA,传统的杂交捕获以及RNase H的方法耗时耗力,步骤很多,纯化步骤多,而导致起始样本量较高,由于临床检测pcr free的特殊性对于混合去除有了更高的要求,QIAGEN给大家带来了专门针对病原微生物需要同时去除人、细菌的rRNA的产品解决了传统实验带来的弊端。

QIAseq FastSelect Epidemiology Kits

用于从人类、小鼠、大鼠和细菌样本中快速去除 RNA-seq 文库制备的 rRNA

特征

• 与 QIAGEN、Illumina、NEB 和 KAPA 链 RNA-seq 文库试剂盒兼容

• 提供从片段或全长 RNA 中去除泛细菌 5S/16S/23S rRNA,以及去除人类、小鼠、大鼠和相关细胞的细胞质和线粒体 rRNA物种

• 用于细菌和 HMR(人类、小鼠和大鼠)的单独试剂,可灵活用于单或双 seq 应用

• 简单的程序可与现有工作流程配合使用,以节省时间

QIAseq FastSelect Epidemiology Kits 专为“双序列”或“宿主-病原体”RNA-seq 文库构建而设计。使用 QIAseq FastSelect Epidemiology Kits 构建 RNA-seq 文库的研究人员将去除细菌 5S/15S/23S rRNA 以及人类、小鼠和大鼠细胞质和线粒体核糖体 RNA。我们的综合 rRNA 去除试剂设计使用 16S(近 600,000 个条目)、23S(近 170,000 个条目)和 5S rRNA 序列(超过 7200 个条目)。计算机模拟预测所有已知 5S、16S 和 23S rRNA 序列的 rRNA 去除率 >95%。可容纳从低至 20 ng 到 1 µg 的 RNA 量,具有始终如一的高性能,并且与低质量、高度片段化或高质量的全长 RNA 兼容。由于 QIAseq FastSelect 不使用酶消化或杂交捕获程序,快速、简单的工作流程可在下游应用中实现可靠的 rRNA 去除和高重现性。用于去除细菌和 HMR rRNA 的试剂在单独的试管中提供,使研究人员能够优化双序列、细菌或 HMR 样本的 RNA-seq 工作流程。

QIAseq FastSelect Epidemiology Kits 使用一种新方法从您的 RNA-seq 文库中去除科学价值低的高丰度 RNA。它们已经过 QIAGEN、Illumina、Roche/KAPA 和 NEB RNA-seq 文库试剂盒的测试,并且与所有主要的 RNA-seq 文库制备方法兼容。简单的 14 分钟 FastSelect 流程和随后的基于微珠的清理与所有常见的 RNA-seq 文库试剂盒无缝集成,可用于片段化或全长(非片段化)RNA。我们建议使用QIAseq Stranded RNA Library Kits为高质量和高度片段化的 RNA 快速、可靠地制备链特异性 RNA-seq 文库。并且可以设计您自己的定制 QIAseq FastSelect 试剂,以从您的 RNA-seq 文库中删除您希望的任何 RNA。

QIAseq FastSelect Kit 工作流程

只需将 QIAseq FastSelect 试剂(rRNA Removal 和/或 Globin Removal)添加到您的 RNA 样本中,进行片段化(如果需要),然后在 14 分钟内从 75°C 逐步冷却至 25°C。然后,研究人员无需对其工作流程进行任何额外更改即可完成剩余的文库制备步骤。QIAseq FastSelect 在有或没有 RNA 片段化的情况下均可使用,提供了使用 FFPE 或降解的 RNA 样本或高质量 RNA 作为标准 RNA-seq 文库构建工作流程的一部分的灵活性

QIAseq FastSelect –5S/16S/23S 与其他方法比较:rRNA 去除

还有更多惊喜哦

QIAseq FastSelect –rRNA HMR kits

用于从人类、小鼠、大鼠和其他哺乳动物样本中快速去除 rRNA 和/或globin mRNA以制备 RNA-seq 文库

特点:

✔ 与 QIAGEN、Illumina、NEB 和 KAPA 链 RNA-seq 文库试剂盒兼容

✔ 用于人、小鼠、大鼠和其他哺乳动物物种的单一试剂

✔ 仅需 14 分钟即可去除高性能 rRNA 和/或globin mRNA,然后完成剩余的文库制备步骤

✔ 只需一个移液步骤——将 QIAseq FastSelect 试剂与 RNA 结合并孵育

✔ 无需额外的清理步骤或 NGS流程更改

✔  也适用于FFPE和降解的RNA样本

 

整个去除只需将 QIAseq FastSelect 试剂(rRNA 去除和/或globin去除)添加到 RNA 样品中,进行片段化(如果需要),将反应从 75°C 逐步冷却至 25°C共 14 分钟,然后完成剩余的文库制备步骤。 除此之外,QIAGEN还提供了果蝇、酵母、线虫、植物、泛细菌、鱼的FastSelect核糖体去除试剂。


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