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临床预测模型构建:构建预后模型和诊断模型流程【干货】

2022-03-21 15:19 作者:尔云间  | 我要投稿

废话不多说,直接上干货

构建临床预测模型主要步骤包括哪些?

临床预测模型并不像拟合统计模型那么简单。从模型的建立、验证、评价到应用,都有一个完整的临床预测模型研究过程。一般都是借助可视化图形和六个重要步骤来构建疾病预测模型:

1.      选择一组预测因子作为潜在的疾病影响因素,并将其纳入风险评分;

2.      选择合适的统计模型,来分析预测因子与疾病的关系;

3.      从现有预测因子中通过各种算法(LASSOCOXSVMRF等)选择具有显著意义或非常重要的变量,将其纳入风险评分;

4.      构建风险评分模型;

5.      风险评分模型性能评估或者评价;

6.      解释风险评分模型在临床实践中的应用;

7.      研究风险评分模型与热点关联(免疫微环境,肿瘤突变负荷TMB等)。

了解了构建预测模型基本流程之后,你可能觉得收集患者样本或数据会花费大量的时间,那么你要是这样想就大错特错,在这个人工智能火热、测序技术普遍的时代,除了自己收集样本之外,还可以通过公共数据库数据啊(例如TCGA、GEO和GTEx等)都可以利用

下面我们就列举一些近年来,临床预测模型与热点研究(m6A、免疫浸润、铁死亡、细胞焦亡等)结合的高分纯生信论文(公共数据库挖掘)。

有了数据之后你又觉得不会构建预测模型的相关方法、算法或者技术。这点你就更不用担心了因为我们的千聊课程就提供了这些技术方法。除此之外,还提供了构建预测模型、热点研究(m6A、免疫浸润、铁死亡、细胞焦亡、坏死性凋亡、乳酸代谢、药物代谢、内质网应激、氧化应激等等)这样类似的分析支持,如果你有兴趣或者需求,请关注我们的宫主号eryunjian2014咨询或者查看更多的干货。

秀一些我做好的分析图表!

图1:预后模型构建(lasso-cox算法)


图2:诊断模型构建
图3:与免疫浸润关联
图4:突变数据分析
图5:亚型或者亚组预测
图6:WGCNA分析

怎么样,挺不错的吧,有没有高分SCI既视感?

快来和小编聊聊吧!


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