COSMOlogic——快速学习化合物的计算

COSMOtherm计算需要筛选参与该过程的分子的电荷分布有问题的系统。屏蔽电荷分布可以从屏蔽电荷表面上获得在量子化学宇宙计算中计算的分子。宇宙的结果计算存储在扩展名为COSMO的文件中。cosmo或。ccf。

为了在COSMOtherm中使用，COSMO文件必须在一个量子化学级别上生成，以便这是一个宇宙热参数化。对于标准化学和工程热力学的应用，我们建议使用TZVP或者TZVPD-FINE水平。这两个水平都基于DFT计算得到的分子结构，但TZVPD-FINE水平涉及使用TZVPD基组的额外QM能量计算。通常地TZVP级别的COSMOtherm计算速度更快，而TZVPD-FINE级别的计算速度稍好后果取决于所涉及的化合物数量、可用的计算机电源以及如果需要精度，其他级别可以更好地用于其他目的。COSMOtherm从化合物的COSMO文件中读取化合物信息并进行转换将屏蔽电荷表面转化为屏蔽电荷分布，称为σ-轮廓有关分子结构通常是不需要的，因此被丢弃。

因为σ-根据分子结构的不同，一种化合物的构象轮廓可能不同，合规者必须单独计算。如果一种化合物中存在多个构象的COSMO文件，它们将结合成一种化合物。有关COSMO计算中的构象选择和Cosmotherm中的构象处理的详细信息，请参阅第5.3节“启动”，Cosmothermx workplace窗口中有两个选项卡：化合物和属性可从化合物选项卡中选择化合物。有两种方法可以做到这一点：

从其中一个数据库中，选择所需的级别，然后从计算机系统上的目录中单击“从数据库”按钮，单击“从文件”按钮否从其中一个数据库中选择化合物，选择一个级别，例如TZVP，然后打开包含所有可用化合物的数据库。“数据库”对话框有几个功能默认情况下，将列出所选级别的所有嵌入式数据库中的化合物。可以使用相应的复选框选择或取消选择数据库。通过选中第一列中的复选框，将鼠标悬停在数据库directoCompounds的位置上，以供选择。当按下ADDSELECTION to Composite LIST或ADD SELECTION&CLOSE（添加选择和关闭）按钮时，所有标记化合物将被转移到主窗口中的Composite部分。双击化合物也会将化合物转移到Composite部分窗口单击列标题会根据该列对数据库进行排序。默认情况下，将选择化合物的所有符合项。如果取消选中“使用所有一致性”复选框，则只有能量最低的一致性才会转移到化合物部分n。如果需要能量最低的一致性以外的特定一致性，则第一个完整的一致性集合。关闭数据库对话框，突出显示复合部分中的符合项集。使用鼠标右键打开复合上下文菜单，然后选择Decompose CONFORMER SET。然后从复合区B中删除不需要的符合项，点亮它们并按下可搜索数据库表的键。输入搜索字符串（姓名、公式、Cas号码、微笑代码），然后按Asiarch或search smiles处理搜索。

要从目录树中的某个位置选择化合物，请单击文件管理器按钮。转到所需化合物的COSMO文件所在的目录，并突出显示这些文件。几个在单击文件名的同时按住Ctrl或Shift键，可以突出显示文件。要将突出显示的COSMO文件传输到复合区，请按文件管理器窗口左侧的选择按钮。如果无法从COSMO文件中识别参数化，您将被要求选择适合所选文件的参数化。确保使用了一个四参数化，即与量子化学宇宙计算中使用的DFT泛函和基集相对应的一个。所选化合物在化合物部分列出。有关化合物列表其他选项的详细信息，请参阅第5章

文件可以通过保持“r”或“Shift”来突出显示“在单击文件名时按下。若要将突出显示的COSMO文件转换到复合区，请按文件管理器窗口左侧的选择按钮。如果无法从COSMO文件中识别参数化，则需要选择一个参数化以适合所选文件。请确保使用一个适当的参数化，即对应的参数化。”根据量子化学宇宙计算中使用的DFT泛函和基集，选择的化合物在化合物部分列出。有关化合物列表其他选项的详细信息，请参阅第5章