尔云间生信代码|用于临床诊断和临床决策影响的DCA分析
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临床决策曲线分析(Decision Curve Analysis, DCA)是一种评估临床预测模型、诊断试验和分子标记物的简单方法。传统的诊断试验指标如:敏感性,特异性和ROC曲线下面积仅测量预测模型的诊断准确性,未能考虑特定模型的临床效用,而DCA的优势在于它将患者或决策者的偏好整合到分析中。而这种理念的提出满足了临床决策的实际需要,在临床分析中的应用日益广泛。因此,本软件DCA就是测量预测模型的生物标志物的诊断准确性和临床效用。
使用方法:
Rscript DCA.R -input=
参数说明:
USAGE:
DCA.R -input=<input>
PARAMETERS:
-input the expression data,the first column is sample name,the second column is group,the third column is gene symbol,input txt format.
操作步骤:
1、打开命令行界面,输入“Rscript DCA.R”调阅帮助文档,确定该程序所需的输入文件。
2、用户根据帮助文档中的参数说明内容,对参数进行设置。这里,必须输入参数有1个,分别是-input,表示表达数据,第一列是样本名称,第二列是分组,第三列是基因符号,输入txt格式。
3、完成参数提交后,按下回车键,整个程序即正式开始进入执行。每步执行内容都会给出提示。程序执行完毕后,界面会显示”Program execution is completed<span data-raw-text="" "="" data-textnode-index-1661741864823="13" data-index-1661741864823="667" class="character" style="margin: 0px; padding: 0px;">"结束语。
流程图:

结果展示:
1. DCA.pdf

2. Clinical Impact Curve.pdf

该图表示临床影响变化风险曲线
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写在文末:
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