BioSciTools完善多组学程序及菜单栏层级
1.Update Description
2. Algorithm 算法程序
3. Genomics 基因组学
4. Transcriptomics 转录组学
5. Proteomics 蛋白质组学
6. Metabolomics 代谢组学
7. Clinical 临床医学
8. MicroOrganism 微生物组
1.Update Description
BioSciTool
v1.3.1
Website:https://bioscitools.github.io
Github:https://github.com/bioscitools/bioscitools.github.io
亲爱的BioSciTools用户:BioSciTool
再次美化和更新布局,完善菜单分类及层级,同时新增30
款组学数据分析程序。主要包括:①
Algorithm 算法
分类中的PairsCorrelation, BetweenStats, WithinStats, PercentBlock
等;②
Genomics 基因组学
分类中的HG19GeneExp, HG19GeneMarker, ChloroplastGenome, MitoGenome, MafTiTv, MafAAChange, MafSomaticInteraction
等;③
Transcriptomics 转录组学
分类中的ExpressionTrend, BubbleOrdinary
;④
Proteomics 蛋白质组学
分类中的NetworkTree
;⑤
Metabolomics 代谢组学
分类中的PartialLeastSquares, ScorePLS, LoadingPLS, WeightPLS, OrthogonalPLS, ScoreOPLS, LoadingOPLS, WeightOPLS
;⑥
Clinical 临床医学
分类中的SensitivityROC, TimeROC, AnatoGram, BrainMap
;⑦
MicroOrganism 微生物组
分类中的TernaryDiagram, OTUTree
。以下将从程序界面美化、分析程序更新简单展示叙述。



2. Algorithm 算法程序
2.1 PairsCorrelation
配对相关性分析及可视化

2.2 BetweenStats
组间比较统计及小提琴图可视化

2.3 WithinStats
组内比较统计及小提琴图可视化

2.4 PercentBlock
矩形比例布局可视化

3. Genomics 基因组学
3.1 HG19GeneExp
基于人类基因组HG19的基因表达圈图

3.2 HG19GeneMarker
基于人类基因组HG19的基因表达圈图及关键基因位置标记

3.3 ChloroplastGenome
植物叶绿体基因组圈图可视化

3.4 MitoGenome
线粒体基因组圈图可视化

3.5 MafTiTv
基因变异数据的单个碱基转换和颠换

3.6 MafAAChange
基因变异数据中氨基酸变异

3.7 MafSomaticInteraction
基因变异数据中染色体间的交互

4. Transcriptomics 转录组学
4.1 ExpressionTrend
转录组基因表达趋势图谱

4.2 BubbleOrdinary
转录组基因表达气泡图

5. Proteomics 蛋白质组学
5.1 NetworkTree
蛋白质网络图

6. Metabolomics 代谢组学
6.1 PartialLeastSquares
基于偏最小二乘法对各样本中所有代谢物分析

6.2 ScorePLS
基于偏最小二乘法代谢物得分图

6.3 LoadingPLS
基于偏最小二乘法代谢物载荷图

6.4 WeightPLS
基于偏最小二乘法代谢物权重图

7. Clinical 临床医学
7.1 SensitivityROC
基于临床生存分析的ROC及AUC曲线

7.2 TimeROC
多时间基于临床生存分析的ROC及AUC曲线

7.3 BrainMap
脑图数据可视化

8. MicroOrganism 微生物组
8.1 TernaryDiagram
微生物组学分析中三元图

8.2 OTUTree
微生物组学中物种OTU进化树
