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BioSciTools完善多组学程序及菜单栏层级

2023-03-09 20:52 作者:BioSciTools  | 我要投稿
  • 1.Update Description

  • 2. Algorithm 算法程序

  • 3. Genomics 基因组学

  • 4. Transcriptomics 转录组学

  • 5. Proteomics 蛋白质组学

  • 6. Metabolomics 代谢组学

  • 7. Clinical 临床医学

  • 8. MicroOrganism 微生物组

1.Update Description

BioSciTool v1.3.1
Website: https://bioscitools.github.io
Github: https://github.com/bioscitools/bioscitools.github.io

亲爱的BioSciTools用户:
BioSciTool再次美化和更新布局,完善菜单分类及层级,同时新增30款组学数据分析程序。主要包括:

Algorithm 算法分类中的PairsCorrelation, BetweenStats, WithinStats, PercentBlock等;

Genomics 基因组学分类中的HG19GeneExp, HG19GeneMarker, ChloroplastGenome, MitoGenome, MafTiTv, MafAAChange, MafSomaticInteraction等;

Transcriptomics 转录组学分类中的ExpressionTrend, BubbleOrdinary

Proteomics 蛋白质组学分类中的NetworkTree

Metabolomics 代谢组学分类中的PartialLeastSquares, ScorePLS, LoadingPLS, WeightPLS, OrthogonalPLS, ScoreOPLS, LoadingOPLS, WeightOPLS

Clinical 临床医学分类中的SensitivityROC, TimeROC, AnatoGram, BrainMap

MicroOrganism 微生物组分类中的TernaryDiagram, OTUTree

以下将从程序界面美化、分析程序更新简单展示叙述。

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Figure.1 BioSciTools-20230107
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Figure.2 BioSciTools-Drawer-20230107
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Figure.3 BioSciTools-Menu-20230107

2. Algorithm 算法程序

2.1 PairsCorrelation
配对相关性分析及可视化

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Figure.2.1 PairsCorrelation

2.2 BetweenStats
组间比较统计及小提琴图可视化

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Figure.2.2 BetweenStats

2.3 WithinStats
组内比较统计及小提琴图可视化

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Figure.2.3 WithinStats

2.4 PercentBlock
矩形比例布局可视化

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Figure.2.4 PercentBlock

3. Genomics 基因组学

3.1 HG19GeneExp
基于人类基因组HG19的基因表达圈图

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Figure.3.1 HG19GeneExp

3.2 HG19GeneMarker
基于人类基因组HG19的基因表达圈图及关键基因位置标记

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Figure.3.2 HG19GeneMarker

3.3 ChloroplastGenome
植物叶绿体基因组圈图可视化

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Figure.3.3 ChloroplastGenome

3.4 MitoGenome
线粒体基因组圈图可视化

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Figure.3.4 MitoGenome

3.5 MafTiTv
基因变异数据的单个碱基转换和颠换

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Figure.3.5 MafTiTv

3.6 MafAAChange
基因变异数据中氨基酸变异

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Figure.3.6 MafAAChange

3.7 MafSomaticInteraction
基因变异数据中染色体间的交互

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Figure.3.7 MafSomaticInteraction

4. Transcriptomics 转录组学

4.1 ExpressionTrend
转录组基因表达趋势图谱

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Figure.4.1 ExpressionTrend

4.2 BubbleOrdinary
转录组基因表达气泡图

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Figure.4.2 BubbleOrdinary

5. Proteomics 蛋白质组学

5.1 NetworkTree
蛋白质网络图

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Figure.5.1 NetworkTree

6. Metabolomics 代谢组学

6.1 PartialLeastSquares
基于偏最小二乘法对各样本中所有代谢物分析

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Figure.6.1 PartialLeastSquares

6.2 ScorePLS
基于偏最小二乘法代谢物得分图

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Figure.6.2 ScorePLS

6.3 LoadingPLS
基于偏最小二乘法代谢物载荷图

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Figure.6.3 LoadingPLS

6.4 WeightPLS
基于偏最小二乘法代谢物权重图

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Figure.6.4 WeightPLS

7. Clinical 临床医学

7.1 SensitivityROC
基于临床生存分析的ROC及AUC曲线

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Figure.7.1 SensitivityROC

7.2 TimeROC
多时间基于临床生存分析的ROC及AUC曲线

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Figure.7.2 TimeROC

7.3 BrainMap
脑图数据可视化

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Figure.7.3 BrainMap

8. MicroOrganism 微生物组

8.1 TernaryDiagram
微生物组学分析中三元图

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Figure.8.1 TernaryDiagram

8.2 OTUTree
微生物组学中物种OTU进化树

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Figure.8.2 OTUTree


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