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BioSciTools美化布局与新增10个子程序

2023-03-09 20:50 作者:BioSciTools  | 我要投稿
  • 1.Update Description

  • 2.Update User Interface UI

  • 3 New Applications

    • 3.1 Seq Motif

    • 3.2 BarStat

    • 3.3 ScatterPlot

    • 3.4 GroupLine

    • 3.5 QQ (Quantile-Quantile)

    • 3.6 DensityNormal

    • 3.7 BoxStat

    • 3.8 ViolinStat

    • 3.9 PieStat

    • 3.10 DonutStat

1.Update Description

BioSciTool v1.3.0
Website: https://bioscitools.github.io
Github: https://github.com/bioscitools/bioscitools.github.io

亲爱的BioSciTools用户:
此次更新从v1.2.5直接更新到v1.3.0,意味着BioSciTool再次美化和更新布局,同时此次大更新带来用户数据分析中使用频率较高的10款数据分析及可视化应用。主要包括Statistics分类中的BarStat, ScatterPlot, GroupLine, QuantileQ(QQ), DensityNormal, BoxStat, ViolinStat, PieStat, DountStat,以及Sequence分类中的Seq Motif程序。以下将从程序界面美化、分析程序更新简单展示叙述。

BioSciTools中的宗旨是编写功能最健全的分析程序,每个程序都倾注着开发者的大量时间调研、斟酌,希望能成为用户得心应手的分析工具,每个程序的参数接口都值得去体验和巧妙使用。

2.Update User Interface UI

更新BioSciToolsUI界面主要为了使得程序更加简约、舒服、现代化,我也是在不断探索中审视自己的审美观,最终发现好的界面需要逻辑清晰、界面简约舒适。

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Figure.1 BioSciTools-Animation-UI
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Figure.2 Animation

Home添加BioSciTools IntroductionApplications Stat

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Figure.3 BioSciTools-Intro-Stat

Home添加所有的程序卡片完善后美化,现在通过点击对应程序的卡片预览可以直接打开程序开始分析。

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Figure.4 BioSciTools-Home-Apps

为所有程序添加调节图像宽度(Width)、高度(Height)和分辨率(DPI)的调节组件,每张图像默认以黄金比例0.618:1导出。同时为大多数程序添加标题(Title)、X轴(xLabel)、Y轴(yLabel)的标题修改接口。

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Figure.5 BioSciTools-App-Size-Title

3 New Applications

3.1 Seq Motif

Sequence Motif图可以直观清晰的反应序列偏好特征,每个位置出现的碱基或氨基酸类型反映了该位置序列的偏好性,每个字母的大小与该碱基在该位置上的出现频率成正相关。这种表现方式对研究转录因子结合、RNA修饰等有重要指导意义,时常被应用到论文中。

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Figure.6 SeqMotif

3.2 BarStat

柱状图允许主题自定义、SCI配色选择。柱状图/条形图变换,柱状图不分组统计标准误、标准差、箱型图,柱状图分组可排列、堆叠、百分比等形式展示。

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Figure.7 BarStat

3.3 ScatterPlot

散点图允许主题自定义、SCI配色选择。不同分组以颜色区分、以散点形状区分、同时以颜色与形状区分。包含13种SCI配色,包含25种散点形状。

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Figure.8 ScatterPlot

3.4 GroupLine

分组线性图,根据每组的散点以折线、曲线连接,即折线图。提供主题选择、颜色选择,允许不同分组可以以颜色区分、散点形状区分、同时以颜色与散点形状区分。

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Figure.9 GroupLine

3.5 QQ (Quantile-Quantile)

QQ Plot也就是Quantile-Quantile Plots,是通过比较两个概率分布的分位数对这两个概率分布进行比较的概率图方法。如果两个分布相似,则该Q-Q图趋近于落在y=x线上。如果两分布线性相关,则点在Q-Q图上趋近于落在一条直线上,但不一定在y=x线上。

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Figure.10 Quantile-Quantile

3.6 DensityNormal

根据数据分布密度可视化并添加正态分布线,程序支持多种主题、配色选择,运行在一个面板中可视化多组数据,或者将每组数据以面板分割可视化。

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Figure.11 DensityNormal

3.7 BoxStat

箱线图在传统的图像上支持多组数据单面板或多面板可视化,程序同样支持多种主题和配色。箱线图中可以添加散点、四分位线、统计学数据。

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Figure.12 BoxStat

3.8 ViolinStat

小提琴图在传统的图像上支持多组数据单面板或多面板可视化,程序同样支持多种主题和配色。可以添加箱线图、散点、四分位线、统计学数据。

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Figure.13 BoxStat

3.9 PieStat

饼图支持根据数据自动计算百分比,默认保留两位小数,每个扇形、扇形之间的Gap区域皆运行用户自定义美化,包括颜色、透明度、标签。

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Figure.14 PieStat

3.10 DonutStat

同心圆图类似与饼图,支持根据数据自动计算百分比,默认保留两位小数,每个扇形、扇形之间的Gap区域皆运行用户自定义美化,包括颜色、透明度、标签。

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Figure.15 DonutStat

以上为此次大版本更新的内容,祝大家科研生活愉快!

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