Science的2篇溶酶体最新研究，下一个生信分析热点就是它！抓紧入手让你的文弯道超车！

2022年9月Science杂志背靠背连发了两篇关于溶酶体的研究。第一篇使用基因组CRISPR筛选技术来识别溶酶体酶转运因子(LYSET)，该因子对组织蛋白酶依赖性病毒(包括SARS-CoV-2)的感染至关重要，是溶酶体酶转运所必需的。

第二篇发现LYSET缺陷细胞的溶酶体酶被耗尽，大胞饮作用和自噬底物的转运受损，证实LYSET是溶酶体酶转运途径的核心成分。

连发2篇Science是不是足以说明溶酶体是研究的热点呢？

还记得小云之前跟你们分享过为什么要关注溶酶体？

以及如何从生信分析的角度切入溶酶体？

既然是热点，我们肯定要抓紧时间先进行公共数据的挖掘，做生信分析，为后续的课题思路打基础。

没有思路、不知道怎么分析的找小云，超多个性化、创新性高的分析思路供你选择！

虽然目前还没有单纯分析溶酶体的生信文章发表，但小云还是在茫茫文章中找到了已发表的、少量的、多多少少与溶酶体关联的生信文章。。。

1、通过KEGG分析发现差异表达基因（DEGs）在溶酶体相关通路富集

这篇文章常规分析了疾病组和对照组的DEGs，然后进行GO和KEGG分析，KEGG途径富集分析显示，DEGs主要富集于溶酶体途径。

那么，如果你的生信分析结果也与之类似，发现一些DEGs富集到溶酶体通路，那么完全可以针对这些溶酶体相关的基因进行深入分析。

2、分析溶酶体相关的基因作为疾病的诊断标志物

比如这篇文章分析出溶酶体相关跨膜蛋白5 (LAPTM5)是高血压左室肥厚的潜在诊断标志物。

还分析了LAPTM5的表达与活性氧(ROS)和自噬相关基因的关系，发现LAPTM5的表达与大多数ROS和自噬相关基因呈显著正相关。

3、分析溶酶体相关的基因与疾病的关系

这篇文章分析了溶酶体相关跨膜蛋白4B (LAPTM4B)的表达与与样本类型(正常/原发肿瘤)的相关性、与肿瘤分期的相关性、与肿瘤组织学(腺癌、鳞状细胞癌和正常)的相关性。

4、分析溶酶体相关的基因作为疾病的预后标志物

这篇文章分析出溶酶体谷氨酰胺转运体SLC38A7作为肺鳞癌的预后标志物，根据SLC38A7蛋白高表达(红色)或低表达(蓝色)，绘制鳞癌患者总生存期(OS)的Kaplan Meier曲线。

文章小结

近期连续发表的多篇CNS文章都证明溶酶体是一个研究热点，那么溶酶体也会很快成为下一个生信分析热点！

趁着现在溶酶体相关的生信分析思路还没涌现，可分析的空间非常大，我们可以查找溶酶体相关的基因集，进行生信分析，肿瘤和非肿瘤疾病都可以分析。可以是分析溶酶体相关基因、溶酶体相关signature、溶酶体相关非编码RNA等与疾病的相关性，还可以将溶酶体相关基因与其他热点（比如铁死亡、代谢等）关联分析。如果有单细胞测序数据也可以分析哦