反应力场 reaxff计算

ReaxFF是新一代的分子力场，除传统力场的基本性质之外，可以模拟体系中的化学反应。ReaxFF具有模拟速度快的优点，能够处理较大体系的化学反应过程。在材料科学中有着极大的应用前景，帮助设计和开发新材料。

结合案例以反应力场计算所需的文件、力场验证、命令解读、程序获取与选择、结果计算与可视化；进阶部分以溶液中的质子转移、碳化硅表面石墨烯的生长为例，带大家走通整个ReaxFF反应力场应用的过程。

ReaxFF基础理论

1  ReaxFF反应力场理论概述

1.1 ReaxFF反应力场的发展历程

1.2 ReaxFF反应力场的理论基础

1.3 ReaxFF反应力场参数分枝与详解

1.4 ReaxFF反应力场的应用领域

ReaxFF基础入门

2  ReaxFF反应力场基础入门

2.1 所需输入重要文件详解包括 control,  geo, ffield等文件

2.2 结合实例，讲解输入文件命令行，输出文件

2.3 ReaxFF反应力场简单实例操作及结果查看

2.4 ReaxFF反应力场开发所需文件，力场验证方法（参数或反应路径扫描）

2.5 ReaxFF反应力场运行软件(standalone ReaxFF, ADF,LAMMPS)和程序获取

2.6 ReaxFF 反应力场的选取和准备

ReaxFF计算软件

3 分子建模，可视与计算软件

3.1 建模软件gview, material studio

3.2 可视软件molden, VMD, OVITO

3.3 ReaxFF计算软件 standalone ReaxFF, ADF, LAMMPS

3.4 ADF运行文件设置

3.5 LAMMPS运行设置

ReaxFF特殊功能

4 ReaxFF特殊功能介绍（主要针对adf和standalone ReaxFF程序）

4.1 改变体系温度或体积tregime.in, vregime.in, 加电场 eregime.in等

4.2 随机产生给定比例的混合物

4.3 geo文件的产生, 设定电荷, 限制键长键角和扫描等

4.4 指定时间在体系中添加和删除特定分子

4.5 产物化学组分分析与结果可视化

4.6 巨正则蒙特卡洛模拟gcmc设置

4.7 偏执势蒙特卡洛模拟fbmc设置

ReaxFF进阶实例 

5 ReaxFF进阶实例操作，理解计算模拟的过程及物理意义

: 实例操作：溶液中的质子转移(JPCB,JPCL文献)

1. 建立初始模型：重点注意事项(minimization->nvt->compress->npt->nvt)

2. 输入文件设置, 开启输出unfolded坐标文件

3. 模拟步骤：能量最小化，压缩，系综平衡等

4. VMD查看结果分析：msd，扩散系数，rdf，sdf, 质子追踪等

ReaxFF进阶实例 

: 实例操作： 碳化硅表面石墨烯的生长（Chem. Mater文献）

1. 建模与输入文件，表面选取与准备

2. 热分解法生长石墨烯，删除表面硅

3. cvd法生长石墨烯，添加乙炔分子

4. 可视评估石墨烯质量 （模拟结果统计与可视化）