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新型冠状病毒的自述(上)

2020-04-30 16:01 作者:上海欧易生物  | 我要投稿


自2019年12月横空出世,不到一个月我的名字响彻大地,各种媒体新闻头条谈的都是我。人类拿起手机的第一件事是刷当天确诊了我和多少人类有亲密关系,跟多少人类有暧昧关系,跟多少人类相爱相杀,而多少人类跟我断绝了关系。我已经被人肉到几乎没有任何秘密可言,现在人类“谈冠色变”。人类想方设法探究我的来历,企图一举消灭我。而我,也一直对自己的身世充满好奇……

我是谁?

我从哪里来?

要到哪里去?

我是谁?

在人类眼中,我是+ssRNA病毒(单股正链RNA病毒),长度约为30kb,属于基因组最大的RNA病毒之一,学名:2019-nCoV(n代表Novel,CoV代表Coronavirus冠状病毒)。生物学分类:套式病毒目(Nidovirales),冠状病毒科 (Coronaviridae),Beta冠状病毒属(Betacoronavirus)。我的基因组全序列公开透明:http://virological.org/t/novel-2019-coronavirus-genome/319,我的样子▼

图1 | 2019-nCoV在细胞内的电镜观察

图2 | “自拍”

我出身名门,家族中近年来比较出名的是严重急性呼吸综合征(SARS)和中东呼吸综合征(MERS),我的家谱▼

图3 | 病毒系统发育树

我从哪里来?

尽管我的外在和内核都暴露在人类面前,我从哪里来的还是未知之谜。众说纷纭,因为我与云南发现的中华菊头蝠携带的病毒(Bat CoV RaTG13)全基因水平一致性高达96%,与浙江省舟山中华菊头蝠携带病毒(bat-SL-CoVZC45和bat-SL-CoVZXC21)一致性近90%,最新几项研究认为我还是来自蝙蝠,但怎么由蝙蝠传至人类的仍有很多未知因素。蝙蝠直接传染人类,还是与SARS和MERS相似,蝙蝠先传染某种华南海鲜市场的动物,再由这种动物将病毒传递给人?

图4 | 冠状病毒的感染路径

也有不同团队利用不同分析方式(基因密码子偏好性及病毒感染模式)提出,蛇和水貂也可能是动物宿主,鉴于之前所有冠状病毒只感染哺乳动物及鸟类,部分科学家认为没有证据支持蛇是动物宿主。

华南农业大学的团队宣布通过分析1千多份宏基因组样品,锁定穿山甲为我的潜在中间宿主,因为其分离的病毒株与我的序列相似度高达99%

还有一些阴谋论认为我是美国实验室制造出来的专门针对亚裔的生化武器或者是武汉的P4实验室自己制造的生化武器外泄等等。生化武器是存在的,但“针对某一个人种的生物武器不存在”,因为“我们并不存在生物学意义上的特定的一个人种。”而武汉P4实验室是在2018年1月5日才正式启用,距离武汉在2019年底肺炎爆发不到两年时间,若真的有人在不到两年时间内造出了这个病毒,不仅需要合适的动物模型和细胞,还需要中彩票的运气。更何况P4实验室安全程度非常、非常高,几乎不存在不小心外泄的可能性。

至于我到底从哪里来的,让人类继续猜一猜……

我的刺突蛋白(Spike protein)S-蛋白,能和人的呼吸道上皮细胞以及肺组织的血管紧张素转化酶2(ACE2)结合,让我不知不觉的溜进细胞,之后直接以我为翻译模板,表达出病毒RNA聚合酶。再利用这个酶完成负链亚基因组RNA(sub-genomic RNA)的转录合成、各种结构蛋白mRNA的合成以及复制。结构蛋白和基因组RNA复制完成后,将在宿主细胞内质网处装配生成新的冠状病毒颗粒,并通过高尔基体分泌至细胞外,完成周期。

图5 | 冠状病毒细胞内复制模式

我该何去何从?

我的传播途径主要有三种:包括患者喷嚏、咳嗽、飞沫、呼气近距离吸入等直接传播;飞沫混合在空气中形成的气溶胶传播;以及飞沫沉积在物品表面,通过手进入口、鼻、眼的接触传播。最近听说还出现了粪口传播、母婴传播。我对紫外线和热敏感,56℃ 30分钟、乙醚、75%乙醇、含氯消毒剂、过氧乙酸和氯仿等脂溶剂均可有效灭活我,而氯己定不能有效灭活我。

人类采取了封城封路,戴口罩、勤洗手等一系列物理手段来孤立我,许许多多的厂商在开发新的核酸检测试剂盒试图第一时间发现我,可惜没有特效抗病毒药物来消灭我,而春运这样的黄金时期,就是我的狂欢节,我在继续发展壮大……

你准备好了和我一起共存么?

END

文章源自欧易生物微信公众号

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