shotgun和TMT

Shotgun鸟枪法蛋白质组学是一种自下而上的蛋白质组学分析策略，这种分析策略将完整蛋白质酶解消化为小分子肽段，通过液相色谱进行分离后进行串联质谱分析，根据质谱数据信息如肽段母离子的质荷比（m/z）等结合生物信息学软件进行数据分析，以实现蛋白/多肽序列以及含量分析等。

TMT串联质量标签是一种典型的Shotgun基于鸟枪法的蛋白质标记定量技术。同位素标记包括用合成的含有轻或重同位素的试剂化学修饰靶肽，由于这些标记的化学性质相同，但质量不同，因此可以在质谱中检测到质量差异，从而区分混合样品中的实验组和对照组。TMT涉及多个同位素化学基团的附着，这些基团在MS/MS分析期间产生独特的质量离子。TMT由三个基团组成：用于连接伯胺（或蛋白质硫醇）的胺特异性反应基团、在MS分析过程中产生独特质量离子的报告基团以及确保每个标签具有相同精确质量的平衡基团。在质谱分析过程中，只有质量报告基团被切割和检测，因此通过增加质量报告基团中的重同位素数量，同时减少平衡基团中的重同位素数量，每个标签获得唯一的报告离子质量。该技术最多可以使用10个同位素标签来标记多肽的氨基，允许同时对10种蛋白样品进行相对定量。常见基于鸟枪法的蛋白质定量技术还包括Label Free、SILAC和iTRAQ等。

百泰派克生物科技采用Thermo Fisher的Orbitrap Fusion Lumos质谱平台结合nanoLC-MS/MS纳升色谱提供基于Shotgun鸟枪法的TMT定量蛋白质组学服务技术包裹，可同时对多种蛋白样品进行快速精确的定量鉴定。百泰派克生物科技还可根据需求提供定制化的蛋白质定量方案，欢迎免费咨询。