微生物多样性“全新”升级——“ASV”质的飞跃
近年来，微生物群落的组成和多样性研究逐渐成为农业及医学科研热点，越来越多的研究开始致力将微生物多样性作为基础研究。因此，微生物多样性的数据分析也被越来越多的研究者所关注和学习。为助力广大微生物领域的科研工作者，中科新生命《微生物多样性v2.0》全新起航，接下来，让我们一睹新流程的独特风采吧。
特征提取更新换代
提高样本的物种注释率
16s/18s功能预测新利器
PICRUSt2（Phylogenetic Investigation of Communities by Reconstruction of Unobserved States）是基于群落标记基因序列丰度预测菌群功能丰度的软件，诸如KEGG同源基因，COG同源蛋白簇。相对PICRUSt1，PICRUSt2进行了以下提升：
数据库规模
PICRUSt2算法逻辑图
真菌ITS到功能分类“神器”
我们使用FUNGuild数据库，完成真菌ITS从特征序列到功能注释的跨越。其涵盖了超过12000个真菌的功能注释信息。根据营养方式分为三类：
FUNGuild预测结果
差异分析更加丰富
基于三种距离算法的差异分析
STAMP分析结果
LEfSe分析结果
中科新生命《微生物多样性v2.0》，全流程QIIME2分析，内容包括 ASVs分析及物种注释、α-多样性、β-多样性、物种差异与标志物种分析、组间群落结构差异显著性检验、环境因子关联分析以及功能预测等，技术路线如下：
