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DNA上先驱转录因子的序列依赖性表面凝聚

2022-02-16 23:33 作者:geneXplain  | 我要投稿


微信公众号: geneXplain

这是一篇在《Nature Physics》的近期科研报道

生物分子凝聚物是蛋白质的密集组装体,它们形成不同的生化区室而不被膜包围。一些,例如 P 颗粒和应力颗粒,表现为液滴并包含数百万个分子。其他的,例如在 DNA 表面形成的转录凝聚物,很小,含有数千个分子。 DNA表面上形成小凝聚物的物理学仍在讨论中。

来自德国马克斯普朗克复杂系统物理研究所的Frank Jülicher博士和来自马克斯普朗克分子细胞生物学和遗传学研究所的Stephan W. Grill博士的团队共同合作,使用先驱转录因子 Krüppel 样因子 4 (Klf4) 研究转录因子缩合物的性质。

Frank Jülicher博士和Stephan W. Grill博士的团队通过实验证明 Klf4 在高浓度下可以自行相分离,但在低浓度下,Klf4 仅在 DNA 上形成凝聚物。使用光学镊子,他们证明这些 Klf4 凝聚物在 DNA 上形成一种表面凝聚。这种表面凝结涉及从薄吸附层到厚凝结层的开关状转变,这显示了预润湿转变的标志。 DNA上缩合物的定位与序列相关,表明Klf4在DNA上的缩合物形成是表面缩合的序列依赖性形式。预润湿与序列特异性一起可以解释表面冷凝物的大小和位置控制。他们推测,先锋转录因子在 DNA 上的预润湿转变是转录凝聚物的形成和定位的基础,并为转录调控提供了稳健性。


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