产品动态 | 时空云平台STOmics Cloud更新公告
聚焦用户需求，持续迭代更新。全新升级的时空云平台STOmics Cloud已上线。近期主要更新内容如下，详细更新内容可点击文末阅读原文解锁。
项目管理
项目工具
1.【新增】工作流工具授权
该功能用于项目间共享工作流。
在项目内选择工作流，点击操作按钮【授权】，进入授权版本和授权项目选择界面；
选择需要授权的项目，支持多选项目，确认后被授权的工作流出现在目标项目的“引用工作流”分类下，并通过标签显示来源。
2.【新增】批量导入导出工具、工作流
该功能用于导入、导出整个工具或者工作流的压缩包，方便跨环境迁移。
工作流、工具管理界面新增【导入】、【导出】按钮。在系统中选择要导出的工作流，支持复选，点击【导出】按钮，选择的工作流会导出该工作流的所有版本。批量导出的工作流为1个压缩包，目录层级结构如下：
当要将工作流导入到项目中时，点击【导入】按钮，从本地选择文件压缩包导入，如果有重名工作流，系统会自动重命名，即在原名称后增加标号后缀；
工具和工作流导入后，需要将镜像迁移到相应的环境。
3.【新增】工具运行
该功能用于工具运行。
在工具管理界面，工具卡片新增【运行】按钮，点击【运行】按钮，进入运行界面。
4.【优化】运行界面
该功能优化了工作流的运行界面，支持更复杂变量的参数配置。运行界面优化后包含任务信息、输入设置、输出设置。
任务信息为任务名称、创建时间、工作流，任务名称可支持修改，工作流可链接至工作流详情；
输入设置为工作流中定义的参数，新增二维数组类型变量录入，通过点击取值框在二维表格中填写多组元素；
输出设置为输出的结果目录。
项目任务
1.【新增】SAW任务生成的html文件下载
2.【新增】workflow任务详情展示
该功能用于查看workflow所运行任务详情及结果文件。
项目任务列表、任务管理列表新增workflow详情，点击【详情】按钮，展示任务基本信息、输入、输出， 基本信息显示任务名称、流程名称（版本）、状态、创建时间、完成时间；
点击输出文件可跳转至数据管理指定文件的位置，在数据管理操作文件。
3.【新增】失败任务日志
该功能用于查看失败任务的错误日志。
在项目芯片、项目任务管理、任务管理及首页的任务管理列表中，当任务失败时，点击任务状态【失败】，展示失败日志。
4.【新增】任务取消、启动功能
该功能用于用户启用、取消任务。
针对待分析、运行中的任务，点击【取消】按钮，可中止分析，任务状态更新为“取消”；
针对状态为“取消”的任务，可点击【启动】按钮，继续运行中止的分析，状态更新为“待分析”。
5.【优化】任务状态
该功能优化了任务列表的任务状态。
在任务管理列表中，除图像预览任务，任务状态统一为待分析、运行中、取消、失败、完成，新增“取消”状态。针对历史存在的“暂停”状态，仍保留历史数据，新增任务无“暂停”状态。
6.【优化】任务通知邮箱变更为华大时空云平台：cloud@stomics.tech
数据分析
【新增】支持挂载项目数据
挂载数据时，可选择数据管理挂载方式；
挂载后，容器中input目录挂载数据，将挂载本次选择的数据，input目录之前挂载的数据将会被更新。
项目成员管理
【新增】支持用户名或邮箱搜索成员
项目数据
1.【新增】图像元数据自动取值
studio图像入仓后，系统将解析路径或ipr文件内容，从而自动取到图像的以下信息：是否用于分析、染色类型、实验过程、QC Resultfile、图像工具类型。
2.【优化】筛选条件及列设置优化
列设置优化，增加了是否用于分析、实验过程、QC Resultfile、图像工具类型等信息，以方便用户查询及查看文件信息。
3.【优化】元数据编辑优化
元数据编辑界面字段调整。测序信息模块增加字段：CB length、CB start等信息。
流程更新
1.【新增】spatialProteinVisualization_reregister_v0，蛋白手动配准
spatial_Protein_visualization_v0 且带图的任务，可在可视化中投递spatialProteinVisualization_reregister_v0（蛋白手动配准流程）。
可视化
1.【新增】自适应binsize调节
开启自动模式，binsize会根据画布放大倍数进行自动调节。
默认展示bin50；
放大至15%以上时，自动切换至bin20；
放大至40%以上时，自动切换至bin10；
放大至100%以上时，自动切换至bin1。
2.【新增】多基因热图支持双击查看基因详细信息
勾选部分基因，切换展示方案至热图，双击热图中某个bin，可展示当前bin中所包含的各基因详细数量。未勾选基因的状态下暂不支持此功能，多颜色图状态下也不支持此功能。
3.【新增】支持Cellbin下全基因热图展示
Cellbin下可切换至基因表达热图图层，进行细胞维度下的热图展示。
4.【优化】图例功能优化，支持切换图像图例和聚类图例
非Cluster图层下，在Image Layer中勾选图像、或在基因/蛋白列表中勾选复选框并以multi-colored形式展示后，图像图例自动显示；
Cluster图层下，默认展示聚类图例，当有图像图层或基因/蛋白multi-colored图存在时，也可手动切换至图像图例。
高级分析
1.【新增】支持多张芯片批量全流程投递
支持文件增加、删除，可对多张芯片的gef文件进行批量全流程投递。
2.【新增】自动注释：支持自定义reference功能，自动注释提供三种reference来源可选
Default：可从singleR的默认数据库中选取；
StereoMiner Database：可从知识库中选取；
Data Management：用户可下载数据格式模板，将自定义的reference文件上传至STOmics Cloud数据管理模块，从数据管理模块中选取。支持rds和h5ad两种格式。
3.【新增】预处理：增加预处理前后统计信息对比
在PR任务下，查看预处理后的结果时，支持显示细胞数和平均MID数进行过滤前后的数值对比。
4.【优化】自动注释自定义reference：支持对表格进行表头配置
通过StereoMiner Database或Data Management选择自定义reference时，文件列表支持编辑表头，以展示用户更加关注的信息。
StereoCopilot
1.【新增】支持对时空专业问题及时空云平台操作手册的智能问答
2.【新增】支持本地文献上传生成总结
单击按钮弹框可选择本地文献，文献大小限制30M以内、文件格式限为pdf，同时文献内容需包含介绍、摘要等内容；
选择文献后自动发送并生成文献总结。
3.【新增】基于上传文件全文的提问
文件上传成功后，可在右侧会话框输入问题，StereoCopilot将基于上传文件的内容进行回答。
4.【新增】功能插件的自定义选择
在右上方点击插件按钮，可选择需要使用的插件，StereoCopilot将结合插件功能进行回答。
时空知识问答：选择该插件，StereoCopilot将在时空专业知识库搜索相关答案，并根据用户的问题进行总结后返回答案；
实时网页搜索：选择该插件，StereoCopilot将联网搜索Google网页查询最新信息，并根据用户问题进行总结后返回答案。
默认选择时空知识问答插件，用户可根据具体问题切换插件的选择。若不选择插件，将默认使用ChatGPT模型进行回答。
帮助中心
1.【新增】时空云平台STOmics Cloud使用手册和版本更新文档，当前版本仅支持中文版手册
2.【新增】支持关键词搜索
点击右上角搜索框或使用快捷键ctrl+k，输入关键词搜索。
3.【新增】支持切换主题颜色及深色模式
满足用户需求，提供更强大的数据分析工具是时空云平台STOmics Cloud的核心追求。基于此，STOmics Cloud会定期进行更新迭代，不断完善产品体验。目前，除了已经上线的功能，STOmics Cloud也在根据用户实际科研需求开发新功能，更完善、更智能的功能将陆续上线。
