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孟德尔随机安装包(TwoSampleMR)安装

2023-06-16 00:51 作者:无序意识  | 我要投稿

自己刚学MR,因为两个安装包,搞了2天,终于搞定了,做了五六种尝试,最终下面这种方式成功了。也帮朋友成功安装。采用的本地安装。最下面有参考网址,非常感谢网友的建议。

安装包下载

install.packages("devtools")

library("devtools")

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRInstruments.zip')

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRPRESSO.zip')

 

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip')

不行,因为缺乏依赖的包

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip',dependencies = F)

 

#出现ERROR,原因是没有一些依赖包,手动安装这些依赖包

 

#安装TwoSampleMR的依赖包

install.packages("car")

install.packages("glmnet")

install.packages("MendelianRandomization")

install.packages("meta")

install.packages("mr.raps")

install.packages("MRMix")

install.packages("psych")

install.packages("googleAuthR")

 

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/ieugwasr-master.zip',dependencies = F)

 

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRMix-master.zip',dependencies = F)

 

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/RadialMR-master.zip',dependencies = F)

 

#最后安装TwoSampleMR

devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip',dependencies = F)

大家尽量复制,不要漏了词,否则出错很难发现。一些需要GIHUB下载的安装包我已经下载,需要的可以分享给大家,就不需要科学上网找了。最后如果再遇到这种问题其实花钱找专业的弄是最好的,自己真的很浪费时间。

 

参考:https://blog.csdn.net/ACGTexplorer/article/details/127704914

需要本地安装的安装包在这里

链接:https://pan.baidu.com/s/1JBKyfUXL4RxqafQqWrhcIw?pwd=1234 

提取码:1234


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