孟德尔随机安装包(TwoSampleMR)安装
自己刚学MR,因为两个安装包,搞了2天,终于搞定了,做了五六种尝试,最终下面这种方式成功了。也帮朋友成功安装。采用的本地安装。最下面有参考网址,非常感谢网友的建议。
安装包下载
install.packages("devtools")
library("devtools")
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRInstruments.zip')
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRPRESSO.zip')
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip')
不行,因为缺乏依赖的包
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip',dependencies = F)
#出现ERROR,原因是没有一些依赖包,手动安装这些依赖包
#安装TwoSampleMR的依赖包
install.packages("car")
install.packages("glmnet")
install.packages("MendelianRandomization")
install.packages("meta")
install.packages("mr.raps")
install.packages("MRMix")
install.packages("psych")
install.packages("googleAuthR")
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/ieugwasr-master.zip',dependencies = F)
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/MRMix-master.zip',dependencies = F)
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/RadialMR-master.zip',dependencies = F)
#最后安装TwoSampleMR
devtools::install_local('/Users/y/Desktop/TwoSampleMR/TwoSampleMR-master.zip',dependencies = F)
大家尽量复制,不要漏了词,否则出错很难发现。一些需要GIHUB下载的安装包我已经下载,需要的可以分享给大家,就不需要科学上网找了。最后如果再遇到这种问题其实花钱找专业的弄是最好的,自己真的很浪费时间。
参考:https://blog.csdn.net/ACGTexplorer/article/details/127704914
需要本地安装的安装包在这里
链接:https://pan.baidu.com/s/1JBKyfUXL4RxqafQqWrhcIw?pwd=1234
提取码:1234