武装突袭3作为武装突袭系列的第四部作品，沿用了前几作的阵营系统。阵营被分为蓝，红，绿三大军事阵营，以及不参加战斗的平民。

在武装突袭系列游戏中，绿方阵营可能与蓝红两方的其中一方友好，也可能与两方都友好或都敌对。值得一提的是，《闪点行动:冷战危机》和《武装突袭2》中绿军都只有游击队或准军事组织(如果不算维和部队的话)，《武装突袭1》和《武装突袭3》中的绿军则有正规军。

AAF(阿尔蒂斯武装部队)

全称Altis Armed Forces，地中海国家阿尔蒂斯与斯特拉蒂斯共和国的国防部队。

该军队的建立最早可以追溯到这两个岛在16世纪成为大英帝国殖民地的时候。第二次世界大战的1942年11月，几百名阿尔蒂斯籍的士兵前往北非参加了极其惨烈的火炬行动，这次行动几乎葬送了阿尔蒂斯的一代人，尤其是Oreokastro村应征入伍的青年在登陆战中全部壮烈牺牲。战后，为了纪念这些阵亡的士兵，人们在斯特拉蒂斯岛的南端建立了"斯巴达纪念碑"。

冷战结束后，阿尔蒂斯正式脱离英联邦，成立了共和国并加入欧盟。一支守卫岛屿的国防军也随之建立了起来，其名曰AAF。在欧盟的帮助下，这支只有一个营大小的军队逐渐壮大起来，并接受了来自北约各国的装备及军事训练。

随着西方经济危机的爆发，阿尔蒂斯失去了曾经的经济靠山，曾经一度火爆的旅游业也因此迅速衰落，阿尔蒂斯陷入了一片混乱。

2026年，Akhanteros上校突然发动了军事政变，推翻了Kavala的民选政府，并在Pyrgos建立了新的军政府。

军事政变引发的混乱让人们非常不满。随后部分逃兵与旧政府的成员组成了一只准军事部队，与亲Akhanteros的AAF爆发了一场血腥的内战。

虽然政府支持者在内战早期取得了一定的胜利，但在总体势力上仍不敌装备精良的政变军，内战后期逐渐失去了优势。随着2030年耶路撒冷停火协议的签署，Akhanteros的AAF赢得了内战的胜利，大量民选政府的支持者被捕或者失踪。

停火协议签署后，残存的政府支持者组建了FIA游击队继续抗击AAF，包括但不限于袭击车队和军营。AAF内部也出现了腐败，有些AAF高级军官暗地里为FIA游击队提供情报。

虽然北约在内战后派出了神盾特遣队，希望能够让和平更快地回到阿尔蒂斯岛，包括2034年的Kavala会谈。但一系列事件让本来就不乐观局势雪上加霜，FIA的据点Oreokastro村更是成了AAF反击行动的受害者。

随着神盾特遣队的撤出，Akhanteros向CSAT请求支援。CSAT在岛上部署的Griffin军团加大了对FIA的打击力度，同时为AAF提供各种军事训练和支援。

第一团

AAF的主要武装力量，包括所有装甲单位和机械化步兵单位，以及大部分前线步兵单位。该军团和空中、水上单位一齐由Akhanteros上校直接指挥。

东风事件伊始，一部分的AAF士兵在不知道原因的情况下被派往斯特拉蒂斯岛攻击准备撤出的美军维和部队，其他的则继续与Griffin军团在阿尔蒂斯岛的西侧对抗逐渐壮大的FIA游击队。部分装甲部队的成员接受了Griffin军团的训练，学习使用CSAT的新式主战坦克。

面对突如其来的美军第111师的入侵，Griffin军团措手不及，只好要求AAF在前线硬撑着，直到CSAT重要人员和设备完全撤离岛屿。AAF虽然进行了几次反击，但防线很快被美军突破，前线部队损失惨重。英勇的坦克指挥官基罗斯·卡洛格罗斯驾驶着CSAT的T-140主战坦克，领导着装甲部队冲锋陷阵，依旧没能扭转极其不利的局势。钢铁天马的胜利，让本身就陷入穷途末路的AAF腹背受敌。

随着CSAT主要人员和资料的撤出，AAF兵败如山倒，其三分之一的人非死即伤。恶贯满盈的总指挥Akhanteros终于宣布了投降，并在和平会谈后接受了审判。

大部分幸存的AAF士兵和军官在战后被关进了战俘营，由FIA的成员识别其中的战犯。确定为战犯的人员被枪毙，剩下的则退伍回家或和部分FIA成员一起重建军队。

虽然战争已经结束，但战后的阿尔蒂斯和AAF仍然面临一系列挑战......

AAF使用的大多数是老旧的北约装备。AAF士兵穿着21世纪初的军服和单薄的防弹背心，头戴凯夫拉头盔，手持发射老式北约5.56/7.62毫米弹药的步枪(尽管AAF的确装备了发射新式6.5毫米弹药的班用机枪)。AAF曾经从北约、欧盟各国购买了一系列旧式装备并使用至今，包括各种装甲载具和空中载具，尽管装甲部队的确用过两辆新款CSAT坦克。

第三后备团

AAF的后勤部队，指挥官为Thanos Gavras少校。

该军团主要负责各种二线工作，包括维修、补给、医疗、支援等，主要驻扎在主岛的西侧。

在111师空袭部队的猛攻下，第三后备团被打的几乎全军覆没，只有少校和Kostas Dimitriou中尉从Oreokastro村里逃了出来，并乘坐直升机逃离。

其他部队

有资料显示AAF在内战初期曾经有过一支小型的民兵组织，他们穿着破旧的军装，戴着滑冰盔/凯夫拉头盔配巴拉克拉法帽，手持AK步枪或AAF提供的武器。但这些民兵在AAF开始反攻前就已经被政府支持者消灭。

LDF(利沃尼亚国防军)

全称Livonian Defense Force，东欧国家利沃尼亚的国防部队。

LDF的历史最早可以追溯到一战结束后的1920年，Zbigniew Sokolski建立了一个名叫利沃尼亚的国家，作为波兰和立陶宛之间的缓冲小国。波兰在1939年被德国和苏联入侵并瓜分，利沃尼亚随后和波罗的海三国一齐并入苏联。随着苏联的解体，这个小国宣布了独立，并加盟为北约的成员国。

随着东欧局势日益紧张，美军在利沃尼亚的Nadbór地区与LDF的第五军团进行电子战演练，包括训练使用各种频谱设备。军演看似很顺利，但突然发生的一系列莫名其妙的事情让美军和LDF都很不安......

利沃尼亚作为北约的一个成员国，LDF装备的更新和美军保持一定的同步。LDF的士兵身穿夹克军装配新式防弹背心(特殊情况下会穿着CBRN防化服)，手持发射新式6.5毫米北约弹药的Promet系列突击步枪和机枪。由于LDF在Nadbór地区部署的只是一个小军团，其总体的载具阵容我们自然无法得知，但LDF应该保有少量北约旧式载具。

利沃尼亚劫匪

利沃尼亚的不明匪徒武装。据可靠情报称他们身穿T恤长裤或猎人夹克衫，手持双管猎枪、AK突击步枪或Mk14半自动步枪。

但据目击者声称，在部分匪徒的尸体上发现了LDF的军装和武器。没人知道他们在这个地区有什么目的，也没人知道为什么他们和LDF在同个阵营。

塔诺亚游击队

在南太平洋地平线群岛的塔诺亚群岛，先后出现了两个游击队组织。

Syndikat(辛迪加)

第一个游击队组织，老大是Solomon Maru或称"Warlock"，他十年前曾是红狮组织的一名重要人物，但政变的失败使得组织解散。

该组织随着南太平洋海啸的爆发而发展起来，在海啸袭击后的群岛上趁火打劫，包括但不限于劫掠村子和走私毒品。拥有着军事级武器的他们，肆无忌惮地对装备老旧的宪兵队发动各种偷袭，并残忍地杀害宪兵。

CTRG介入后，情报称该组织和不明武装人员在进行某种交易。但包括老大在内的主要成员随后很快被CTRG的特种兵以及后来部署的美军消灭。

辛迪加的武装人员分为战士和匪徒。战士身穿老旧的虎纹迷彩服，匪徒则身穿以短袖短裤为主的平民服装。他们主要手持老旧的AKM步枪和AKS-74U卡宾枪，扛着RPG-7V老式火箭筒，尽管有少数战士使用走私来的AK-12步枪。需要快速移动时，他们一般乘坐四驱吉普车和橡皮艇，但据说老大有私人直升机和私人飞机。

L'Ensemble(大帮会)

虽然说这个新的游击队组织是由前辛迪加成员建立的，但它和辛迪加的关系已经不大。

2038年，随着疟疾的爆发，美军撤出了地平线群岛，由CSAT部队接管该地区。3年前的顶尖协议事件让群岛的居民对CSAT很反感，部分前辛迪加成员便联合了起来，建立了新的游击队对抗CSAT驻军。

相比起以前的辛迪加，大帮会获得了更多的支持。许多村民为了安全而加入大帮会，或者让村庄由大帮会的保护，更有部分酒店为落难的大帮会人员提供庇护。由于建立初期缺少武器，他们与CTRG化敌为友，从而获得了很多新式装备。为了对抗疟疾，他们改行走私抗疟药品，为岛上的医生提供帮助。

大帮会战士的服装和曾经的辛迪加战士没什么差别，但匪徒开始穿长裤、鞋子甚至猎人夹克。由于旧辛迪加的瓦解，大多数武器被宪兵队缴走，新建立的大帮会主要依靠走私贩子和CTRG来获取新的武器。AK-12系列在大帮会成为最常见的武器，但另有很多战士使用由CTRG或武器贩子提供的发射5.56/7.62毫米北约弹药的武器，包括SPAR系列、LIM-85机枪和Mk14射手步枪。部分战士甚至搞到了RPG-42，用于对付CSAT和宪兵队的载具。匪徒从武器贩子那里获得了很多9毫米/.45口径的冲锋枪，以及老旧的双管霰弹枪。载具方面，大帮会仿照曾经的FIA给民用皮卡装上重机枪和火箭筒，其他载具阵容基本不变。