大家好！我是BioLadder生物信息在线可视化云平台的工程师小宇，今天我来给大家分享怎样用BioLadder在线计算蛋白质理化性质！

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1.什么是蛋白质理化性质？

蛋白质理化性质即蛋白的物理化学性质，主要包括长度，分子量，等电点，疏水性。长度和分子量：即蛋白肽段的氨基酸个数，和分子质量。等电点：等电点是一个分子表面不带电荷时的pH值。疏水性：疏水性指的是一个分子与水互相排斥的物理性质。本文我们就来讨论一下怎样用BioLadder做蛋白理化性质计算。

2.绘图前的数据准备

demo数据可以在https://www.bioladder.cn/shiny/zyp/bioladder2/model/new/physicochemical/1.fasta下载。

只支持fasta格式的文件。

在 fasta 文件当中，每一个序列由以下两部分组成：

1.序列的特征性 ID，“>”大于号开头后跟描述信息。

2.具体的蛋白序列。

3. BioLadder生信云平台在线计算蛋白质理化性质

不想写代码？可以用BioLadder生信云平台在线计算蛋白理化性质。

网址：https://www.bioladder.cn/web/#/chart/74

3.1 上传文件

点击“上传”按钮上传自己的文件，上传完成后会在下方实时的展现出来。只支持蛋白fasta格式的文件。上传完数据后，理化性质计算完会在下方显示。

3.2 调整参数

本工具为实时性展示模块，图片为动态可交互图片。可以将鼠标虚浮到图片上面，获得一些交互信息。• 分为多少块：频率分布直方图分为多少个区间。 

3.3 提交查看

点击数据旁边的下载按钮，可以下载xlsx格式的结果文件。点击图片旁边的下载按钮，可以下载html格式的图片结果。

4.BioLadder生物信息在线分析可视化云平台

网址：https://www.bioladder.cn/BioLadder

目前上线了生物学分析最常用的50多个模块，主要包括以下四类：

数据可视化：箱线图，南丁格尔玫瑰图，韦恩图，UpSet图，饼图，词云图，小提琴图，饼图/甜甜圈图，弦图，柱形图等

组学数据分析：序列的多重比对，表达数据的CV曲线图，饼图/甜甜圈图，T-SNE，热图，趋势分析的mFuzz，差异分析的火山图，富集分析的气泡图，修饰位点上下游模体分析的seqLogo，Motif热图等

功能分析：GO弦图，相互作用网络图，富集分析

数据预处理：归一化，补值，FDR校正，长宽表互换等

好了蛋白理化性质的计算就到这里了，后续大家想要了解什么内容可以给我们评论反馈，我们会根据大家的意见持续更新。我们欢迎您以任何方式提出您的优化意见，使BioLadder平台成为广大科研工作者的生物信息分析首选平台！