仅凭3图拿下1区文章！6种疾病也可以整合分析，你没见过这么多疾病整合吧？
纯生信有多香，各位小伙伴都知道呀！纯生信真是解决了不少科研打工人无实验平台或是实验经费不足的烦恼！这不是小云今天又给大家带来一篇纯生信的SCI！这还是一篇1区SCI！ 先来总结一下这篇SCI的特点！第一个特点还是多疾病整合分析啦！当大家还在做双疾病分析的时候！这篇SCI已经悄悄做了6种疾病整合分析了！~目前研究也是主要趋向多疾病的关联的研究，例如已有很多双疾病的SCI文章啦，这篇文章更是做了6种疾病的整合分析！所以多疾病联合分析是趋势呀！第二点切入点也是比较新颖，主要是从神经性厌食症切入，给人一种眼前一亮！第三, GWAS!科研人都懂！所以总结这篇SCI多疾病整合的全基因组分析选对了！ 研究神经性厌食症（AN）和相关表型的共同遗传结构，包括精神分裂症(SCZ)、双相情感障碍(BIP)、重性抑郁(MD)、情绪不稳定(mood)、神经质(NEUR)和智力(INT)。使用基于多效性的条件错误发现率（FDR）统计量，通过结合两个GWAS来鉴定AN位点，以它们与其他表型的关联为条件来识别AN位点。此外，应用ConjFDR来鉴定共同的遗传位点，从而揭示了AN与相关精神疾病和性状之间的其他共享多基因结构。
（ps:不知道如何找切入点或创新升级的可以找小云！）
题目：神经性厌食症和主要精神疾病及相关性状的全基因组分析揭示了遗传重叠，并确定了神经性厌食症的新风险位点
杂志：translational psychiatry
影响因子：IF= 6.8
发表时间：2023年9月
研究背景
神经性厌食症 （AN） 是一种遗传性进食障碍 （50-60%），具有一系列常见的精神疾病和相关特征。尽管已经报道了AN与精神疾病和相关性状之间的显着遗传相关性，但它们的共同遗传结构在很大程度上尚未得到充分研究。
数据来源
研究思路
作者调查了AN与精神分裂症(SCZ)、双相情感障碍(BIP)、重性抑郁(MD)、情绪不稳定(mood)、神经质(NEUR)和智力(INT)的共同遗传结构。应用条件性错误发现率(conditional false discovery rate, FDR)方法识别新的神经症风险位点，结合FDR方法识别神经症与相关表型共有的位点，汇总相关全基因组关联研究(genome-wide association studies, GWAS)数据。个体GWAS样本从72517到420879人不等。利用条件性FDR，发现了58个新的AN基因座。此外，发现了38个在AN和主要精神疾病(SCZ, BIP和MD)之间以及45个在AN和心理特质(Mood, NEUR和INT)之间的独特位点。在遗传相关性方面，大部分共享位点的效应方向一致。功能分析显示，共享的基因座涉及65个独特的通路，其中有几个在分析中重叠，包括参与Hippo信号传导的“MST1信号通路”。结果表明，神经性厌食症与相关疾病和性状之间的一些共同特征可能有遗传基础。
主要结果
1. AN与相关精神疾病和心理特征的遗传重叠和相关性 条件性Q-Q图显示，在每种精神疾病和心理性状的关联p值的条件下，AN的SNP富集程度连续增加(图1)。在条件性状的两个方向上均具有较高显著性的变异的子集持续增加的左偏，表明AN与其他精神疾病和相关性状之间有大量的多基因重叠。 全基因组LD评分回归显示AN与以下疾病和性状显著正相关:SCZ、BIP、MD、NEUR和INT。AN和Mood之间的遗传相关性不显著。某些遗传相关性(如AN和SCZ)的统计显著性高于其他遗传相关性(如MD和SCZ)，尽管点估计值较低，因为估计值的精确度较高。这可能是由于某些表型的遗传度和可发现性较高(例如，SCZ的可发现性高于MD)。
图1条件分位数-分位数图
2. AN与相关精神疾病和心理特征之间共有的位点 ConjFDR分析揭示了AN与相关疾病和性状之间共享的许多位点（见表1），分别有20个、10个和20个位点与SCZ、BIP和MD相关。总之，在神经性神经痛和相关精神疾病之间确定了38个独特的共享基因座。此外，分别有13、29和36个位点与Mood、NEUR和INT联合相关。共有45个位点在AN与心理特质之间具有独特的共通性;其中9个与AN和精神疾病独有的38个重叠。在所有分析中合并物理上重叠的condFDR基因座后，共有56个与AN相关的“唯一”基因座。所有共享位点的曼哈顿图见图2-3。
图2 基于-log10转换的每个单核苷酸多态性的转化conjFDR值的曼哈顿图
图3 基于-log10转换的每个单核苷酸多态性的转化conjFDR值的曼哈顿图
文章小结
其实这篇SCI主要优势是选对了切入点，多疾病整合的全基因组分析更上一层！利用GWAS数据发纯生信SCI也是逐年增加，得益于GWAS在识别新型变异性状关联方面非常成功，发现新的生物机制。目前也有GWAS研究结果具有多种临床应用，并且可以提供对复杂性状的种族变异的洞察力。新颖的生信技术再加新颖的选题就能把握SCI门路。
