SEER与医院数据结合分析，双临床数据库快速拿下5分+高性价比纯生信！！！
临近毕业季，是不是很多小伙伴一定很想发表一篇属于自己的SCI，但是却苦于没有实验环境和样本？选择临床数据库是生信分析的基础，对于临床科研具有非常重要的作用。临床数据库包含了大量的患者信息和医疗数据，可以帮助临床研究人员挖掘数据中的潜在规律和关联关系，并提高医学研究的效率和质量。
通常情况下，生信文章只会引用一个数据库，但今天布小谷就发现一篇简短但性价比极高的文章，作者选择了两个数据库，一个是大名鼎鼎的SEER数据库，结合医院JSPH数据库，对疾病进行了生存分析。结合两个数据库的好处有：1）如果在两个数据库中都有相同结果，那么增加了研究结果的说服力；2）两个数据库让审稿人眼前一亮，增加了接收率。
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题目: 原发性肺淋巴上皮瘤样癌的临床病理特征及癌症特异性预后：美国SEER数据库与中国某医院的人群研究
杂志：Front Oncol
影响因子：IF=5.738
发表时间：2023年5月
研究背景
肺癌是全球癌症相关死亡的主要疾病，可大致分为非小细胞肺癌（NSCLC）和小细胞肺癌（SCLC）。原发性肺淋巴上皮瘤样癌（PPLELC）是一种罕见的组织学类型的非小细胞肺癌，占NSCLC的不到1%。目前，尚无公认的PPLELC治疗指南。
研究思路
在2000 年至 2015 年间SEER数据集确定了 PPLELC 患者 （n = 72），以及在 2014 年至 2020 年间从JSPH确定了 PPLELC 患者（n = 16）。所有诊断均经病理检查确诊，并检索和总结患者的临床病理特征。使用Kaplan-Meier分析和对数秩检验进行生存分析。使用Cox回归风险模型进行多变量生存分析。
主要结果
1.SEER数据集中PPLELC的发病率
根据SEER数据集，2000-2015年期间有816436例确诊肺癌病例。其中，0.065‰的白人患者、0.056‰的黑人患者、0.528‰的亚太岛民（API）被诊断为PPLELC（表1）。这表明在API中，PPLELC亚型在肺癌中的比例更高。
2.PPLELC 病例的临床和人口统计学特征
研究包括了 SEER 数据集中的 72 名患者和 JSPH 队列中的 16 名患者。其中，两个 PPLELC 队列的中位诊断年龄均为 64 岁，范围为 15 至 86 岁。女性和男性的发病率相似。右肺偏侧 (47/88, 53.4%) 的病例多于左肺 (39/88, 44.3%)。超过一半的病例被诊断为 TX/T1 期（55.7%），而 T2、T3 和 T4 期的比例分别为 26.1%、10.2% 和 8.0%。大多数病例（54/88，61.4%）淋巴结转移呈阴性，其余34例（38.6%）淋巴结转移呈阳性。上述呈阳性的34例中，N1期11例，N2期21例，N3期2例。88例中，69例（78.4%）行病灶切除术，16例（18.1%）行束流放疗，40例（45.5%）行化疗。在 JSPH 队列中，只有两例为 65岁或以上，与 SEER 数据集相比有显着差异。有趣的是，43.8% (7/16) 的病例显示肿瘤位于右肺中叶内。相比之下，只有6.9%的 SEER 病例显示了这个肿瘤位置，而且都是 API，证明这种差异似乎与种族有关。尽管 M1 期病例的百分比在 SEER 队列和 JSPH 队列中相当，但治疗选择似乎不同。在 JSPH 队列中，接受手术切除的病例更多（87.5% 对 75.0%），接受放疗的病例更少（6.3% 对 20.8%）（表 2）。
3.PPLELC 病例中癌症特异性生存率（CSS）的生存分析
截至追踪期结束时，有24例因PPLELC死亡。1年、3年和5年癌症特异性生存率（CSS）分别为90.8%、79.5%和72.6%（图2A）。平均CSS时间为148.7±12.6个月。接下来，利用Kaplan-Meier生存分析，根据临床和人口统计学特征将患者分为不同的亚组（图2B-E）。KM曲线显示，患者的M分期显著影响PPLELC的CSS（图2B）；M0期患者的5年CSS率为78.5%，M1期患者降至40.7%。此外，患者的N分期也影响预后（图2C）；TNM III-IV期患者的预后始终优于TNM I-II期患者（图2D）；接受手术切除的患者的5年CSS率为78.8%，而未进行手术干预的患者仅为48.7%（图2E）。相比之下，其他因素似乎对PPLELC存活率没有显着影响。使用 Cox 回归风险模型对多个变量（年龄、性别、TNM分期、手术切除、放疗和化疗）进行分析（表3），发现TNM分期是唯一对PPLELC生存有独立预后影响的因素。
文章小结
研究对比了SEER数据集和JSPH数据集中PPLELC患者的临床病理特征，当前治疗和预后。研究证明了PPLELC在亚洲人中发病率较高，预后良好；其中，TNM分期是PPLELC的独立预后因素。文章分析思路虽然简单，但是作者利用了SEER和JSPH两个数据库，增加了分析的可信度，两个数据库得出结果一致，也增加了结果的可靠性。内容不多还能发到5分+，可见SEER真的是一个可参考的好方向。感兴趣的小伙伴一定要码住！
