每日科研进展 l 2022.06.22 l dsRNA的位置效应对科罗拉多马铃薯甲虫RNAi效率的影响

害虫的抗药性推动了以RNAi为基础的害虫防治新技术的发展。为了研究dsRNA的位置依赖性的影响,该文章设计了四种不同的针对科罗拉多马铃薯甲虫(CPB)β-Actin基因的200 bp dsRNA,分别为dsACT200-1、dsACT200-2、dsACT200-3、dsACT200-4,以及之前研究报道的200 bp长度的dsACT200以及700 bp长度的dsACT700,分别比较它们对CPB幼虫的杀虫活性。
通过数据平台预测相关的序列,每个dsRNA都含有不同数量的siRNA,dsACT200和dsACT200–2的siRNA数量相对高于其他200 bp的dsRNA。

用体外合成的dsRNA处理马铃薯叶片,随后喂养CPB幼虫时,所有被测dsRNA对CPB幼虫都有显著的抑制作用。

结合CPB幼虫存活率、β-Actin基因表达水平和存活CPB幼虫体重,来自同一等位基因的不同位置的dsRNA对CPB幼虫表现出不同的植物保护活性,并与预测的siRNA数量和靶序列上的分布存在一定的相关性。

这项研究表明,合理设计dsRNA的特定等位基因位点触发靶基因沉默的RNAi效率是增强杀虫活性的关键因素。
原文链接:
https://doi.org/10.1016/j.pestbp.2022.105121