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实现组织特异性干扰的工具——miR30结构

2023-06-09 16:09 作者:小恒学术  | 我要投稿

RNAi实验是研究基因功能的常用实验之一,shRNA的持续性表达通常借助于pol III型启动子,包括U6和H1,但要想实现特定组织中的基因沉默,几乎少不了特异性启动子及pol II型启动子的助力,然而U6和H1并不具有组织特异性,显然无法达到实验目的。那么有什么方法可以解决这个问题呢?

 

基于miR30的shRNA

大家还记得之前关于shRNA的干货内容吗?(没有印象的小伙伴可以查找“siRNA和shRNA的区别”阅览哦)shRNA和miRNA具有相似的作用机制(见图1),因此我们可以用miRNA的骨架(目前常用miR30)构建shRNA载体,即可由pol II型启动子驱动干扰载体,实现特定组织中的基因沉默。

 

 

图1 miRNA和siRNA作用机制

 

具体构建方案为将miR30的5'flanking region和3'flanking region序列保留,然后将其成熟区域的序列替换成靶点序列,示意图如下:

 

图2 基于miR30结构的shRNA载体

 

Mir30结构的优势

(1)启动子选择性多:基于miR30的shRNA可以通过多种pol II启动子转录,包括CMV、CAG和特异性启动子等。

(2)可与报告基因共表达:报告基因与shRNA共表达,方便检测shRNA的转录。

 

案例分享

安徽医科大学的王学富教授在题为“G protein-coupled receptor 35 attenuates nonalcoholic steatohepatitis by reprogramming cholesterol homeostasis in hepatocytes”的研究论文中使用了汉恒生物提供的AAV8-TBG-miR30-shRNA(Stard4)-mcherry特异性敲低小鼠肝脏中Star相关脂质转运蛋白4(Stard4)表达以研究G蛋白偶联受体35(GPR35)在非酒精性脂肪性肝病的作用(NAFLD),使用AAV8,用肝脏特异性启动子TBG,尾静脉注射,检测肝脏中Stard4的表达,发现其蛋白水平明显降低(见图3)。

 

图3 Stard4 WB结果图

文章链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36970193/

 

沈阳药科大学的吴春福教授的研究团队在题为“Hyperactive neuronal autophagy depletes BDNF and  impairs adult hippocampal neurogenesis in a corticosterone-induced mouse model of depression”的研究论文中使用了汉恒生物提供的AAV-hSyn-miR30-shRNA(Atg5)特异性敲低神经元中自噬相关基因5(Atg5)的表达来研究神经元自噬对抑郁症的影响,为抑郁症治疗提供了新的思路。

 

文章链接:https://pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/36793868/

 

综上,miR30结构是实现特定组织基因沉默的有力工具,若对组织特异性干扰有疑问,欢迎咨询汉恒生物


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