单细胞测序样本处理指南(四)- 组织样本的速冻保存和运输(用于提核)

速冻保存的组织样本适用于单细胞核的抽提实验,高质量的单细胞核,可用于随后的单细胞核测序(snRNA-Seq)以及单细胞染色质可及性测序(scATAC-Seq)等实验。如因实验时间或实验条件所限,不能立即进行单细胞核抽提实验,可选择将组织样本进行速冻保存和运输。
一、动物组织样本的速冻保存
💠 将动物组织样本(保证每份样本湿重>100mg)放入盛有预冷的PBS的培养皿中,反复润洗以去除组织表面的筋膜和血块。最后用干净纱布或吸水纸吸干液体(防止液体在组织表面形成冰晶),注意操作迅速,全程保持在冰上操作。
💠 将动物组织样本放入事先做好标记的冻存管(管壁与管盖上都做好标记),立即投入液氮速冻2min以上,随后可置于-80℃短暂保存(1周内)。
💠 将装有样本的冻存管转移至液氮中长期保存,并记录相应样本信息和冻存位置信息。
💠 速冻保存的组织样本:建议置于干冰环境中维持冷冻运输(-78℃),寄送前请先预估运输时间,确保运输过程中保留有足够干冰,运输过程中注意做好缓冲保护。
二、植物组织样本的速冻保存
💠 选取生长状态良好,幼嫩部位的植物组织(保证每份样本>1g),放入盛有预冷ddH2O的培养皿中,反复润洗以去除组织表面的泥土等杂质。最后用干净纱布或吸水纸吸干液体(防止液体在组织表面形成冰晶),注意操作迅速,全程保持在冰上操作。
💠 将组织样本放入事先做好标记的冻存管(管壁与管盖上都做好标记),立即投入液氮速冻2min以上,随后可置于-80℃短暂保存(1周内)。
💠 将装有样本的冻存管转移至液氮中长期保存,并记录相应样本信息和冻存位置信息。
💠 速冻保存的组织样本:建议置于干冰环境中维持冷冻运输(-78℃),寄送前请先预估运输时间,确保运输过程中保留有足够干冰,运输过程中注意做好缓冲保护。
三、速冻样本的注意事项
💠 需保证组织状态良好,离体后立即速冻,并且保存和运输条件良好。
💠 珍贵样本可以减少用量,但每份样本量至少要保证能获得10万个细胞核。
💠 为确保实验顺利进行,推荐每个样本准备3份,每份单独分装,一份为预实验样本,因为不同物种、不同组织的实验参数需要优化;一份为正式实验样本;一份为备份。
💠 请同时在管壁与管盖上标记样品信息,并且标记清晰。
💠 为避免速冻的离心管在运输过程中破碎,建议使用冻存管运输。如使用1.5mL离心管,请确保其质量良好,或者运输时将1.5mL离心管装入15mL离心管中。
💠 对生物样本进行速冻过程中,会频繁使用液氮。请佩戴护目镜等安全保护措施,并避免液氮飞溅泼洒,以免烫伤。