六、药物-靶点-通路-疾病网络

1.数据整理

（1）创建新EXCEL，将药物名输入第一列，第二列复制进药物-疾病靶点交集，如下图。

（2）在KEGG数据表中依次筛选靶点名称，继续输入第一列，将其对应的通路复制进第二列，如下图。

（3）将疾病名继续输入第一列，将其对应的通路复制进第二列，如下图。

2.Cytoscape

（1）打开软件，点击“Import Network from File System”，选择刚整理好的EXCEL文件，点击“打开”。

（2）点击药物名称（Rhamnocitrin），选择“Source Node”。

（3）点击靶点名（NOS2），选择“Target Node”，点击“OK”。

（4）拖动节点分类，从左至右依次为药物、靶点、通路、疾病，如下图。

（5）点击“Apps”→“CytoNCA”→“Open”，勾选“Betweenness”项目下“without weight”，点击“Analyze”。

（6）框选靶点，点击“Layout”→“Attribute Circle Layout”→“Selected Nodes Only”→“Betweenness”，通路同上。

（7）调整到合适位置即可，美化可参考上文。

（8）右下角定位调整到合适位置，点击“Export to File…”→“Export as Image…”，点击“Browse”，选择保存位置，输入文件名，点击“保存”，“Zoom（%）”调整到500%，点击“OK”，即可导出图片。

（完）