ASReml-R 4.2:让线性混合模型的计算更加的灵活、高效和准确
更多实用功能 更少使用障碍
ASReml-R 4.2

备受期待的ASReml-R新版本4.2 现在可以下载了。
ASReml-R 4.2将允许您在不影响准确性的情况下更快地拟合复杂模型。我们相信ASReml-R 4.2将显著提高您的分析能力,作为我们的主要客户之一,我们诚邀您下载体验!
以下是您可以期待的一些令人兴奋的新功能:
分析速度更快:ASReml-R 4.2使您能够更快地拟合具有更大数据集的复杂模型。优化和线程化数学例程的显著提升了计算速度。
使用ASReml-R 4.2进行因子分析MET分析的速度快40倍。
使用消费级的新版本ASReml-R 4.2,预测模型的速度提高了85倍。
更高的资源利用率:ASReml-R 4.2结合了改进的处理速度、例程增强和优化内存访问:以更好地利用服务器和云服务。轻松完成复杂的分析,最大限度地提高资源效率,更快地完成任务。
文档的改进:增强和扩展的文档为您提供了必要的命令行、技术细节和代码示例。确保您可以使用ASReml-R4.2的全部功能来有效地运行您的模型。
01 ASReml 4.2的主要新功能和优点
并行处理
在多核机器上,您的分析可以分为更小的部分,全部同时运行,使您能够更快地获得结果。ASReml-R 4.2针对多线程处理进行了优化,使您可以使用多个线程。这大大提高了处理速度,有时甚至可以快70倍。(这些收益取决于多种因素,包括:微处理器、机器功率、数据集大小和分析类型等。例如,在ASReml-R 4.1中,18144项创纪录的MET试验在一台配有16 GB RAM和CPU Intel®Core的机器上花费了21个多小时进行处理™ i7-3770K。ASReml-R 4.2在2.9小时内完成了同样的工作。使用8线程多处理,时间再次减少到26分钟:速度几乎提高了50倍。
系谱修剪/吸收父母
谱系修剪和吸收没有数据的父母可以节省计算时间。这种谱系预处理从谱系中去除了不必要的个体,加快了可能性评估,同时保持了核心成员之间的适当关系。
内存访问(工作区)
内存访问已增加到最大96 GB,使您能够在更短的时间内分析更大的问题。在多用户系统上,通过允许每个用户指定其当前会话所需的内存量,可以最大限度地提高内存效率。(最大分配取决于您电脑上的可用空间。我们建议请求的工作空间不要超过您电脑上可用的RAM。)
优化内部程序
ASReml-R 4.2的许多核心例程都经过了重新设计,使其比以前的版本快得多。在具有相对密集的G矩阵的作业中,计算时间通常减少40%以上。
拟合二元GLM(M)模型
以前版本的ASReml R允许对二元分布变量和线性模型变量进行二元分析。ASReml-R 4.2扩展了广义线性模型的二元分析。现在,这两个变量都可以用正态、二项式、泊松、伽马或负二项式分布进行分布。
02 ASReml-R 4.2 vs ASReml-R 4.1
VSNi公司于2023年6月发布了ASReml-R4.2, 这里我们用同样的数据,分析GBLUP和ssGBLUP,看一下ASReml-R4.1和ASReml-R4.2运行的时间以及结果。
ASReml-R4.1版本:

ASReml-R4.2版本:

数据描述
基因型数据:1500
系谱数据:2560
表型数据:2560
分析模型:GBLUP,ssGBLUP单性状模型
电脑配置:windows系统,内存16Gb
ASReml-R 4.1运行时间和结果

GBLUP运行:66.66s
ssGBLUP运行:131.17s
ASReml-R 4.2运行时间和结果


GBLUP运行:4.84s
ssGBLUP运行:23.46s
对比测试结果如下:
ASReml-R 4.1
GBLUP运行:66.66s
ssGBLUP运行:131.17s
ASReml-R 4.2
GBLUP运行:4.84s
ssGBLUP运行:23.46s
主要结论:
我们针对新版本ASReml-R 4.2和旧版本ASReml-R 4.1进行了对比测试。就GS的分析而言,两者结果方差组分和遗传力以及育种值完全一样,4.2相对于比4.1,单性状GBLUP分析速度提升了16倍,单性状ssGBLUP分析速度提升了6倍。如果是多线程的服务器,提升效果更明显。
03 ASReml-R 4.2 体验与下载
最新版本ASReml-R 4.2公测上线,欢迎下载体验!
为了方便大家下载与体验,最新版本ASReml-R 4.2 的(Window,Linux,Mac版本)安装包已经放置于QQ群文件,新老客户可以进行体验使用,没有激活码的老师可以联系我们申请短期的免费试用。

