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科研代码分享|生物信息分析之SCI热门图表—KM曲线和tROC曲线

2022-06-20 15:37 作者:尔云间  | 我要投稿

科研有捷径,输入代码,一键获取科研成果!就是这么省事,来具体看下有多方便!

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真香提示:文末可以知道如何获取代码~

在生物信息学分析中,对于表达谱数据,我们经常需要筛选与肿瘤预后显著相关的因子。而通过KM曲线和tROC曲线可以直观的观察到不同分组或者因子与生存预后的关联,因此是做肿瘤预后评估中必备的可视化方式之一。 

利用纯生物信息学分析发表高分SCI,KM曲线和tROC曲线是预后分析中必不可少的可视化展示方式。如下图。这是来自Frontiers in Immunology的一篇IF > 7分生信文章。

文献中的KM曲线和tROC曲线


但是具体要如何实现??? 今天,小编以代码提供的数据为例进行说明。

码具体包括:

Step1 输入数据(第一列是样本,第二列是生存时间,第三列是生存状态,第四列是评分,第五列是分组。其中生存时间和生存状态为重要信息)

Step2 R代码绘制KM曲线和tROC曲线

下面是代码中附带数据绘制的KM曲线图


下面是代码中附带数据绘制的tROC曲线图

神奇吧,就是如此简单,我们用的都是入门级函数,稍微懂点R语言就能实现。

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