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生物信息学一非生信人如何看懂生信图合集1(1一16)

2023-02-20 09:24 作者:小方块XXL  | 我要投稿

> 火山图

  1. 常和热图一起出现,展示差异表达的基因
  2. 芯片、测序等组学检测技术结果
  3. 上调或下调,横坐标用倍数(以2为底的对数)表示,纵坐标为p值的负对数

> 热图

  1. 用于展示各种基因或RNA在不同样本中的表达
  2. 给每一个数值分配颜色
  3. 可获得两组中多个样本多个基因的全局直观变化
  4. 聚类,样本和样本之间,表达模式相似(比喻:目录)
  5. 整体表达模式,不能看到单个基因的表达
  6. 延伸用法:药物处理样本的结果
  7. 和火山图一起展示差异性基因表达结果

> 基因集 富集分析 GSEA

  1. 以上两种,基于筛选的差异基因,富集分析是不筛选的差异基因
  2. 例:某通路中所有的基因

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