什么？没有外泌体的数据也能分析外泌体？5分+文章带你看点不一样的生信玩法！

只能基于外泌体数据才能进行外泌体相关的生信分析吗？ 

当然不是！没有数据也能做。

可以基于外泌体相关基因进行分析！

自从2013年外泌体获得诺贝尔奖之后，关于外泌体的相关研究就驶入了快车道。从pubmed上看，外泌体相关的文章数量逐年递增。

而且外泌体涉及的疾病多种多样，功能也很广，比如疾病诊断、药物递送载体、组织再生修复、肿瘤微环境和免疫治疗。。。

小云之前给大家分享过基于公共数据分析外泌体的生信思路。就是从ExoCarta 数据库中下载外泌体数据进行分析。

但是如果没有外泌体数据还能进行外泌体相关的生信分析吗？当然可以，还可以基于外泌体相关基因进行分析哦！小云就用一篇5分+的文章带你看看具体是如何进行分析的。

（文末还有外泌体其他生信思路，不要错过哦）

发表时间：2022年6月

发表杂志：Frontiers in pharmacology

影响因子：IF=5.988

文章题目：一种新的外泌体相关分子分类揭示胃癌中独特的免疫逃逸机制和基因组改变

数据信息

研究思路

基于预后外泌体相关基因的表达谱，采用无监督共识聚类方法对胃癌患者进行聚类，针对两个外泌体相关表型进行分析，包括预后、免疫微环境和基因突变等。通过LASSO回归分析开发了一个基于外泌体基因的signature，并进行风险评分。针对高、低评分组评估免疫特征、对免疫检查点抑制剂的反应和遗传改变。

主要研究结果

总结

看完这篇文章是不是发现，原来没有外泌体的数据也能做外泌体的生信分析！可以基于外泌体相关基因进行分析。那么以此为套路，换一种疾病进行分析，岂不又是一篇文章？

而且几乎所有的细胞都能分泌外泌体，肿瘤和非肿瘤疾病都能做哦，这样能做的分析思路有多了一种选择！

当然，也可以从exobase数据库下载外泌体测序数据进行分析，比如这篇文章：

还可以分析外泌体相关的lncRNA：

也可以将单细胞RNA测序数据+bulk RNA-seq数据联合分析外泌体相关基因：