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干货分享 | 一文了解多重扩增子测序

2023-03-03 15:20 作者:ABclonal-爱博泰克  | 我要投稿


扩增子测序是一种高靶向性方法,用于分析特定基因组区域中的基因变异。扩增子测序主要包括16S rDNA测序、18S rDNA测序、ITS测序及目标区域扩增子测序等。


ABclonal早期推出一款适用于多样品的16S 扩增子测序,详见推文。ABclonal作为酶原料公司,正在积极关注多重扩增酶的应用。






多重扩增与普通扩增的差异



多重扩增子测序即针对感兴趣的目标区域,设计多重PCR引物进行扩增富集并进行测序的技术。通常适用于检测几十到几千个位点,或几十kb以下的区域。





建库流程









多重扩增子测序的优势








多重扩增子应用领域


扩增子捕获测序作为全基因组测序的补充技术是非常有用的,它大大简化了实验流程和分析目标。该技术已被证明是一个快速、有效的技术,并在新一代高通量测序中发挥独特之处,已经产生了许多令人兴奋的新发现,应用领域也越来越广泛。







多重PCR的延伸关联技术







ABclonal相关产品


多重 PCR (Multiplex polymerase chain reaction,MPCR)因在同一体系里加入多对引物合成多对扩增子,易发生引物间及扩增子间的串扰,故需要对体系进行优化,否则会造成检测结果的不准确。


ABclonal有着丰富的聚合酶库,及体系优化的经验,推出了相关系列产品。


1、Truepol 2X PCR Mix for Microbiome(RK20720)一款针对微生物多样性检测开发的产品,对于各种类型的样本均有很高的扩增效率。同时,试剂盒中增加的某些特定因子,增强了产品的抗抑制剂能力,提高了检测的灵敏度,即使存在大量宿主DNA的干扰,仍能够表现出良好的扩增效率,较大地提高微生物检测的成功率。可用于一般及复杂样本,如人类组织样本,土壤样本,粪便样本,空气滤膜样本,沙土样本等。


2、2X Multiplex PCR Master Mix(BK0051)

一款基于新一代热启动高保真聚合酶Gloria Nova 聚合酶而开发的扩增试剂,具有高保真性和优异的扩增性能,同时耐受尿嘧啶,具有3´-5´外切酶活性。


针对多重PCR扩增进行了定向优化,适用于10~100ng起始量的各种gDNA、FFPE、cfDNA模板。优化后的扩增试剂中含有反应所需的dNTPs、镁离子和反应缓冲buffer,可以覆盖宽泛的GC区间与引物Tm值。


3、Multiplex PCR Kit(BK0079)

含有多重PCR专用热启动DNA聚合酶(Multiplex PCR Enzymes),具有优异的扩增性能,同时耐受尿嘧啶;延伸速率1 kb/min;


本试剂盒提供深度优化的专用缓冲液2.5X Multiplex PCR Buffer,能够在默认条件下稳定、高效地完成绝大多数多重PCR检测,适用范围广,最大程度地减少了反应体系优化步骤。还提供Multiplex PCR GC Enhancer,针对某些Panel,添加GC Enhancer可以提高扩增特异性。






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