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经典MD模拟的局限性

2022-10-14 11:45 作者:邱新龙分子模拟小破屋  | 我要投稿

经典MD模拟是一种计算原子、分子体系在相空间中运动轨迹的重要方 法,在研究原子、分子体系的行为和性质方面具有重要的应用。但是,由于进 行经典MD模拟,必须预先构建模拟体系的分子力场,限制了经典MD模拟的 应用范围。事实上,如果没有模拟体系的分子力场,就无法利用经典MD模拟 进行研究。此外,经典MD模拟结果的可靠性,取决于分子力场模型的正确 性。如果分子力场模型不正确,模拟结果就不能正确反映模拟体系的实际行为 和性质。

为了克服经典MD模拟的局限性,可以把第一性原理或半经验的电子结构 计算方法与MD模拟结合起来,实现第一性原理分子动力学模拟(ab initio mo- lecular dynamics, AIMD)。目前,常用的AIMD模拟方法有三种,分别是 Born-Oppenheimer 分子动力 学模拟 (Born-Oppenheimer molecular dynamics, BOMD)、Car-Parrinello 分子动力学模拟(Car-Parrinello molecular dynamics, CPMD)和路径积分分子动力学模拟(path integral molecular dynamics, PIMD) o在BOMD和CPMD中,利用第一性原理方法(包括Schrodinger方程 或密度泛函理论)计算原子间的相互作用力,仍用经典力学处理原子核的运动。 在PIMD中,不但用第一性原理方法计算原子核间的相互作用力,还考虑原子 核运动的量子效应,利用Feynman路径积分方法计算原子核的运动轨迹。


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