知日划重点丨东京大学生物科学专攻33位教授情报盘点（修士篇）
梦中情师竟在东京大学？
生物科学专攻 教授情报大揭秘
说不定“入江直树“就是你的神仙教授
日本留学 顶尖名校
东大生物科学研究室
正在和你say hello：）
好不容易熬到日本疫情逐渐平稳的美好局面，自2019年开始的这场风波，不知燃起了多少热血少年想要学习生物 / 医学的心。「生物科学」，这个学科不仅和生物学完美挂钩，还能让你尝遍跨专业领域融合的美好滋味，可以说是大学院理科考生从万众竞争者中脱颖而出的神仙专业。
最近给到不少文科学部以及大学院的干货，知日自然也不能忘了留给理科同学们的福利。今儿，知日就扔给你一个可以让你笑得合不拢嘴的大！福！利！全宇宙仅有一份的宝藏研究室大盘点！史无前例的东大生物科学专攻33位教授揭秘：）
01
WHY东京大学？
东京大学，也就是人见人爱、谁见谁都夸的东大，是日本七所帝国大学之首的日本最高学术殿堂，也是是日本第一所以现代学制成立的综合大学。作为日本文部科学省“超级国际化大学计划”A类顶尖名校，东大也是东亚研究型大学协会、学术研究恳谈会、卓越研究生院计划、领先研究生院计划的成员。
截止今年，东大在QS世界大学排名中仍然保持前列，综合实力稳居日本第1位、亚洲第6名，世界排名第23名。截至2021年，东京大学已经培养了12名诺贝尔奖得主、6名沃尔夫奖得主、1名菲尔兹奖得主、16位日本首相、以及21位帝国国会议长。
02
生物科学究竟玩什么？
生物科学，显而易见，主要进行以分子水平到细胞器、细胞、组织、器官、个体、集团水平的各种生物现象为素材的教育和研究。该专攻的研究手法囊括了分子生物学、分子遗传学、分子进化学、生物物理学、细胞生物学、发育生物学、生理学、形态学、生态学、系统分类学、群体遗传学等等，可以说是研究手法相当丰富、研究内容也极其广泛。
近年，以动物为特征的高级结构和功能表达机制的研究、基因 / 蛋白质以及细胞器 / 细胞 / 组织 / 器官等相关研究、以阐明人类作为进化产物的人类生物学研究、以及分子细胞个体与集团等各阶层的进化生物学相关研究都是近年来的主要关注以及研究课题。
生物科学专业的同学们，不仅可以选择进入相关工业或者医药等企业就职，也可以考虑进行与生物相关的应用研究以及管理等行业，当然与生物相关的跨专业领域也是当下以及未来的热门之选。
03
WHY东大的生物科学？
东京大学的生物科学专攻以本乡校区的理学部1、2号馆以及浅野校区的理学部3号楼为中心，并囊括了弥生校区、白金校区、柏校区、三崎临海实验所、小石川和日光植物园，总共有约300名大学院生在籍。值得注意的是，在东大这个学霸聚集的神仙宝地，与生物学息息相关的教员&教授，多达3位数！而生物科学专攻的大学院学生数仅为188人，能在东大实现1对1教学指导真的不是梦！
由于东大对于拥有跨专业背景的学生的报考持有非常开放的态度，东大的生物科学专攻可以说是现代生物学发展的多元以及融合的典型代表。虽然东京大学的生物科学专业于2014年由原有的生物化学专业与生物科专攻整合而成，已有7年的教学经验了。虽然看起来建立时间并不是很长，但有不少可以在生物科学业界视为天花板存在的教授卧虎藏龙于此。
东大的生物学专攻设置有生物化学講座、光計測生命学講座、生物学講座三个主要基干讲座，专注于研究从微观到宏观的各种生命现象，鼓励学生通过分子生物学、细胞生物学、生理学、生态学、基因组科学、数理统计学等多种多样的方法论进行各自的课题研究。
・生物化学講座
生物化学講座致力于通过分子、遗传基因来理解并分析生命现象的普遍机制，是一个从生物学和信息科学入手、阐明生命系统的生物信息科学领域。主要的研究课题有小分子RNA对表观遗传基因的调节控制、脑神经系统等个体形成的局部基因表达、功能以及相互作用结构、膜输送体、受体和酶等各种蛋白质结构的发挥功能等与生物信息学以及系统生物学相关内容。
・光計測生命学講座
光計測生命学講座与生物化学講座有所不同，它涉及到最先进的以光为主要载体所进行研究的光生命科学。简单来说，小到核酸、蛋白质、细胞等构成因子，大到脑功能和行动等高级功能控制，都将光成像、光操作、分子测量等方法论对大量数据进行精密的观测、开发和推进应用。该讲座不仅与专业内的生物化学讲座、生物学讲座有着紧密的合作，还和本校的物理学、化学等相关领域也有积极的接触。
・生物学講座
生物学講座听起来和生物化学講座略有相似，但更偏向从分子小层面到细胞、组织、器官、个体、群体大层面所涉及的多样生物现象入手进行教学以及各种以人为对象的研究。该讲座的研究方向也是出奇的多，分子生物学、分子遺伝学、分子進化学、生化学、生物物理学、細胞生物学、生理学、形態学等都是其不可缺少的入手研究方法。
04
说说那些宝藏研究室
· 生物化学講座分野研究室 ·
①飯野 雄一 教授 / IINO Yuichi
研究方向：分子行動遺伝学
🔗研究室链接
http://molecular-ethology.bs.s.u-tokyo.ac.jp/labHP/J/JTop.html
飯野雄一教授擅长利用线虫进行与行动遗传学相关的神经系统构造以及其相关机能的研究。通过对小小线虫的分析，教授甚至可以展开到对生物的学习以及记忆结构、感官接收等神经系统相关的信息处理、“反复无常的行动”发生机制的阐明、信息素引起的个体间相互作用与种内、种间多样性等复杂的课题。
近期研究发表：
2021 May. 25 Glutamate signaling from a single sensory neuron mediates experience-dependent bidirectional behavior in C. elegans., Hirofumi Sato, Hirofumi Kunitomo, Xianfeng Fei, Koichi Hashimoto, Yuichi Iino., Cell Reports. Volume 35, Issue 8, 25 May 2021, 109177DOI: 10.1016/j.celrep.2021.109177
2021 Jan. 27 Roles of the ClC chloride channel CLH-1 in food-associated salt chemotaxis behavior of C. elegans, Chanhyun Park, Yuki Sakurai, Hirofumi Sato, Shinji Kanda, Yuichi Iino, Hirofumi Kunitomo., Elife. 2021 Jan 25;10:e55701DOI: 10.7554/eLife.55701
②濡木 理 教授 / NUREKI Osamu
研究方向：構造生命科学
🔗研究室链接
http://www.nurekilab.net/
濡木理教授专注于在原子分解水平上理解各种生命现象。具体来说，首先学生将需要通过X射线晶体结构的分析，来确定生物学上重要的蛋白质・核酸的立体结构。同时，基于由此得到的信息，建立关于功能表达机制的假设。最后，在进行in vitro以及in vivo的变异体分析的同时验证假设的成立与否。目前，「非翻訳RNA関連」、「膜蛋白質」以及「信号转导与癌症」都是该研究室的主要研究中心。
近期研究发表：
"Cryo-EM structure of the human MT1-Gi signaling complex." Okamoto HH, Miyauchi H, Inoue A, Raimondi F, Tsujimoto H, Kusakizako T, Shihoya W, Yamashita K, Suno R, Nomura N, Kobayashi T, Iwata S, Nishizawa T, Nureki O, Nat Struct Mol Biol, (2021).
"Cryo-EM structure of the beta3-adrenergic receptor reveals the molecular basis of subtype selectivity." Nagiri C, Kobayashi K, Tomita A, Kato M, Kobayashi K, Yamashita K, Nishizawa T, Inoue A, Shihoya W, Nureki O, Mol Cell, (2021).
③塩見 美喜子 教授 / SIOMI Mikiko
研究方向：RNA生物学
🔗研究室链接
http://www-siomilab.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/
对于塩見美喜子教授来说，无论是什么生物，都会在进化的同时形成独自的基因情报。该研究室在以果蝇为对象进行研究同时，发现由20~30碱基长度的“小非编码RNA”驱动的RNA警报素机制、在保护生殖细胞基因组信息和维持个体生殖能力方面起到的核心作用。现在，哺乳动物的生殖细胞也被列入研究对象之中，主要探讨生殖组织中小分子RNA的生物合成机制、转位子在生殖细胞中的表达抑制机制、以及小鼠生殖细胞中的表观基因组形成过程。
近期研究发表：
Onishi R, Yamanaka S, Siomi MC.piRNA- and siRNA-mediated transcriptional repression in Drosophila, mice, and yeast: new insights and biodiversity EMBO Rep. 2021; e53062 EMBO Rep. doi: doi.org/10.15252/embr.202153062
Chikuma S, Yamanaka S, Nakagawa S, UEDA MT, Hayabuchi H, Tokifuji Y, Kanayama M, Okamura T, Hisashi A, Yoshimura A. TRIM28 Expression on Dendritic Cells Prevents Excessive T Cell Priming by Silencing Endogenous Retrovirus J. Immunol. 2021; ji2001003 J. Immunol. doi: doi.org/10.4049/jimmunol.2001003
④黒田 真也 教授 / KURODA Shinya
研究方向：システム生物学
🔗研究室链接
http://kurodalab.bs.s.u-tokyo.ac.jp/en/top_en/
黒田真也教授的研究室旨在通过系统层面，理解多种细胞功能的生物信号转导网络的信号机制调节。同时，鼓励学生对各种生物学过程背后的信号网络，进行编码与解码的数理机制进行研究。该研究室同时使用湿实验和干实验的方法，从系统生物学的角度来尝试认识细胞过程。目前，黒田教授研究室的主要研究课题囊括了葡萄糖代谢的贯穿组学分析、胰岛素效应的时间编码、细胞间信号的信息理论等。
近期的研究成果
Ohashi, K., Fujii, M., Uda, S., Kubota, H., Komada, H., Sakaguchi, K., Ogawa, W. and Kuroda, S., (2018). Increase in hepatic and decrease in peripheral insulin clearance characterize abnormal temporal patterns of serum insulin in diabetic subjects. npj Systems Biology and applications. 4:14. doi:10.1038/s41540-018-0051-6
Yugi, K., Kuroda, S., (2018). Metabolism as a signal generator across trans-omic networks at distinct time scales. Current Opinions in Systems Biology. 8: 59-66. doi: 10.1016/j.coisb.2017.12.002
⑤角田 達彦 教授 / TSUNODA Tatsuhiko
研究方向：医科学数理
🔗研究室链接
http://mesm.bs.s.u-tokyo.ac.jp/
角田達彦教授相对其他教授来说，更加偏医学生物，他擅长通过分析生物分子的庞大数据，来解释癌症等疾病的免疫相关生物现行并探索各种疾病的克服方案以及预防疾病的干预方式。通过混合数据、图像数据、临床信息等方式，了解癌症和与癌症相关的免疫微环境之间的关系。目前，通过综合组学分析以发现新的生命现象、综合组学分析发现疾病的新原因、对生物图像和组学结构的理解都是该研究室的主要研究课题。
近期研究发表：
Sharma A, Lysenko A, Boroevich KA, Vans E, Tsunoda T. DeepFeature: feature selection in nonimage data using convolutional neural network. Briefings in Bioinformatics. 2021 Aug 6: bbab297. doi: 10.1093/bib/bbab297. Online ahead of print.
Murakami T, Tanaka N, Takamatsu K, Hakozaki K, Fukumoto K, Masuda T, Mikami S, Shinojima T, Kakimi K, Tsunoda T, Sawada K, Imamura T, Mizuno R, Oya M. Multiplexed single-cell pathology reveals the association of CD8 T-cell heterogeneity with prognostic outcomes in renal cell carcinoma. Cancer Immunology, Immunotherapy. 2021 Jul 14. doi: 10.1007/s00262-021-03006-2. Online ahead of print.
⑥程 久美子 教授 / UI-TEI Kumiko
研究方向：ゲノム情報生物学
🔗研究室链接
http://ui-tei.rnai.jp/
程久美子教授的研究室，擅长通过基因情报等作用机序，解析RNA的各种新兴机制的同时，来分析分子生物学、生化学以及细胞生物学。基因特异性、siRNA的非对称区域特异性作用、人体基因的siRNA库构筑、miRNA向细胞核输送的分子机制以及miRNA抑制机制及其定量分析都是主要研究方向。
近期研究发表：
Shiomi A, Nagao K, Yokota N, Tsuchiya M, Kato U, Juni N, Hara Y, Mori MX, Mori Y, Ui-Tei K, Murate M, Kobayashi T, Nishino Y, Miyazawa A, Yamamoto A, Suzuki R, Kaufmann S, Tanaka M, Tatsumi K, Nakabe K, Shintaku H, Yesylevsky S, Bogdanov M, UmEDA M. (2021) doi: 10.3390/genes12020271
Kobayashi Y, Miyamoto K, Aida M, Ui-Tei K. (2021) Selection of chemical modifications in the siRNA seed region that repress off-target effect. Methods in Molecular Biology, Design and Delivery of SiRNA Therapeutics, 2282, 17-30. [PDF] doi: 10.1007/978-1-0716-1298-9_2
⑦杉村 薫 教授 / SUGIMURA Kaoru
研究方向：多細胞秩序形成学
🔗研究室链接
http://www.koolau.info/
杉村薫教授的研究室特别关注「在塑造身体时，细胞是如何相互推动、拉动并触发组织的精确变形的？」这一问题。他鼓励学生通过结合机械、遗传干扰、实时成像和贝叶斯推断等方法，研究上皮形态发生调控的物理原则。机械力对个体发育控制、哺乳动物培养细胞群体模式形成、多细胞集团力学定量手法的开发都是该研究室的重要课题。
近期研究发表：
Takeru Takagi, Tasuku Ueno, Keisuke Ikawa, Daisuke Asanuma, Yusuke Nomura, Shin-nosuke Uno, Toru Komatsu, Mako Kamiya, Kenjiro Hanaoka, Chika Okimura, Yoshiaki Iwadate, Kenzo Hirose, Tetsuo Nagano, Kaoru Sugimura, and Yasuteru Urano. Visualization and Manipulation of Actin Cytoskeleton with Small-Molecular Probes. Submitted (2020)
Keisuke Ikawa and Kaoru Sugimura.AIP1 and cofilin ensure a resistance to tissue tension and promote directional cell rearrangement. Nature Communications 9: 3295 (2018).
⑧豊島 有 教授 / TOYOSHIMA Yu
研究方向：システム神経科学
🔗研究室链接
https://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~toyoshimalab/
豊島有教授是东大除了飯野雄一教授以外，另一位通过线虫进行生物学研究的教授。但与其不同的是，豊島有教授的着眼点更倾向于生物的神经科学。豊島有教授鼓励学生通过线虫对周边盐浓度的感知反应实验，解析对线虫的行动有抑制作用的神经系统，并以此在线神经系统的模型、找出其情报处理机构的动作原理。
近期研究发表：
Yu Toyoshima, Stephen Wu, Manami Kanamori, Hirofumi Sato, Moon Sun Jang, Suzu Oe, Yuko Murakami, Takayuki Teramoto, Chanhyun Park, Yuishi Iwasaki, Takeshi Ishihara, Ryo Yoshida, Yuichi Iino. Neuron ID dataset facilitates neuronal annotation for whole-brain activity imaging of C. elegans. BMC BIOLOGY 18 (1). Submitted (2020)
Moon Sun Jang, Yu Toyoshima, Masahiro Tomioka, Hirofumi Kunitomo, Yuichi Iino. Multiple sensory neurons mediate starvation-dependent aversive navigation in Caenorhabditis elegans. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA 116(37) 18673-18683 (2019).
· 光計測生命学講座 ·
①深田 吉孝 教授 / FUKADA Yoshitaka
②小島 大輔 教授 / KOJIMA Daisuke
研究方向：神経機能生化学
🔗研究室链接
http://www.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/fukada-lab/index-j.html
以深田吉孝教授为主导人、 小島大輔为讲师的研究室主要关注点在于对视网膜和大脑中枢神经系统中光信号的接收、转换和传输的分子机制，致力于分析分子运动原理中个体分子的生理机能。目前，该研究室的研究课题主要有生物钟系统的分子分析、记忆形成和生物钟功能的关联、视网膜的光信号转导以及大脑感光分子的功能分析。
近期研究发表：
Yohey Ogawa, Tomoya Shiraki, Yoshitaka Fukada, Daisuke Kojima. Foxq2 determines blue cone identity in zebrafish. Science advances 7 (41) eabi9784. (2021)
Takashi Ogino, Naoya Matsunaga, Takahiro Tanaka, Tomohito Tanihara, Hideki Terajima, Hikari Yoshitane, Yoshitaka Fukada, Akito Tsuruta, Satoru Koyanagi, Shigehiro Ohdo. < Post-transcriptional repression of circadian component CLOCK regulates cancer-stemness in murine breast cancer cells >. eLife 10 (2021)
③上村 想太郎 教授 / UEMURA Sotaro
研究方向：1分子遺伝学
🔗研究室链接
http://www.biochem.s.u-tokyo.ac.jp/uemura-lab/japanese/home_ja.html
1分子遺伝学可能会让很多同学感到迷惑，其实1分子指的就是单分子、单细胞。上村想太郎教授主要对分子及细胞的个体个性进行研究。他提倡通过使用可以详细研究单个细胞或分子的个体性的独创技术，进行疾病的个体化诊断、药物开发、分子机制阐明等。目前研究室的主要研究方向有关于1分子可视化技术对基因的调控机制、以及通过1细胞成像技术阐明细胞功能等。
近期研究发表：
Y. Oguchi*, H. Shintaku, and S. Uemura* Development of a sequencing system for spatial decoding of DNA barcode molecules at single molecule resolution Commun. Biol., 3, 788 (2020)
N. Nitta, T. Iino, A. Isozaki, M. Yamagishi, Y. Kitahama, S. Sakuma, Y. Suzuki, H. Tezuka, M. Oikawa, F. Arai, T. Asai, D. Deng, H. Fukuzawa, M. Hase, T. Hasunuma, T. Hayakawa, K. Hiraki, K. Hiramatsu, Y. Hoshino, M. Inaba, Y. Inoue, T. Ito, M. Kajikawa, H. Karakawa, Y. Kasai, Y. Kato, H. Kobayashi, C. Lei, S. Matsusaka, H. Mikami, A. Nakagawa, K. Numata, T. Ota, T. Sekiya, K. Shiba, Y. Shirasaki, N. Suzuki, S. Tanaka, S. Ueno, H. Watarai, T. Yamano, M. Yazawa, Y. Yonamine, D. D. Carlo, Y. Hosokawa, S. Uemura, T. Sugimura, Y. Ozeki, and K. GodaRaman image-activated cell sorting Nature Commun., 11, 3452 (2020)
④榎本 和生 教授 / EMOTO Kazuo
⑤鈴木 郁夫 教授 / SUZUKI Ikuo
研究方向：脳機能学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~brain/
榎本和生教授和鈴木郁夫教授带领的研究室，致力于通过遗传要素与环境要素对脑神经系统的影响的分析，提炼出个人的个性、情感表达以及精神疾病的发展形成过程。该研究室以老鼠、果蝇和人体的ES / iPS 细胞为研究模型，通过运用生物成像、数理建模、AI机器学习等最新方法，对脑神经网络的形成、发展、再生结构进行研究。
近期研究发表：
Nao Utashiro, Claire Williams, Jay Parrish, Kazuo Emoto. Prior activity of olfactory receptor neurons is required for proper sensory processing and behavior. Scientific Reports; 8: 8580
長谷川恵理・北谷育子・柳学理・榎本和生，「神経突起の選択的除去メカニズム」特集：スクラップ＆ビルドで発達する脳神経回路と高次脳機能，実験医学36号: 1978-1986 (2018).
⑥東山 哲也 教授 / HIGASHIYAMA Tetsuya
⑦吉田 大和 教授 / YOSHIDA Yamato
研究方向：発生細胞生物学
🔗研究室链接
https://www.devcell-u-tokyo.bio/
以東山哲也教授和吉田大和教授为首的発生細胞生物学研究室，倡导通过开发最佳的生物材料和创新的技术，来研究从广泛的生物现象到高层次的生命现象等课题。该研究室目前的主要研究有：转位子装置的分子结构和工作原理、真核生物新型细胞分裂调控分子、组蛋白操作与分析技术的开发以及化学领域等的不同领域融合研究。
近期研究发表：
Kimata Y., Kato T., Higaki T., Kurihara D., Yamada T., Segami S., Morita M.T., Maeshima M., Hasezawa S., Higashiyama T., Tasaka M. UEDA M. (2019) Polar vacuolar distribution is essential for accurate asymmetric division of Arabidopsis zygotes. Proc. Natl. Acad. Sci. USA 116, 2338-2343. https://doi.org/10.1073/pnas.1814160116
Ohno M., Ando T., Priest D.G., Kumar V., Yoshida Y., Taniguchi Y. (2019) Sub-nucleosomal genome structure reveals distinct nucleosome folding motifs. Cell 176, 520-534.e25. https://doi.org/10.1016/j.cell.2018.12.014
· 生物学講座 ·
①角谷 徹仁 教授 / KAKUTANI Tetsuji
②稲垣 宗一 教授 / INAGAGI Soichi
研究方向：遺伝学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~iden/
角谷徹仁教授和稲垣宗一教授的这个研究室与其他的研究室有些不同，他们从植物入手，进行遗传学和表观遗传学的研究。该研究室主要使用和分裂酵母为实验对象，研究遗传和表观遗传机制，通过遗传学方法、基因组学和生物化学分析的相结合，对表观基因组进行进一步的探究。
近期研究发表：
Inagaki S, Takahashi M, Takashima K, Oya S, Kakutani T (2021) Chromatin-based mechanisms to coordinate convergent overlapping transcription. Nature Plants 7, 295-302. Pubmed
To TK, Nishizawa Y, Inagaki S, Tarutani Y, Tominaga S, Toyoda A, Fujiyama A, Berger F, Kakutani T. (2020) RNA interference-independent reprogramming of DNA methylation in Arabidopsis. Nature Plants 6, 1455-1467. Pubmed
③久保 健雄 教授 / KUBO Takeo
④國枝 武和 教授 / KUNIEDA Takekazu
研究方向：細胞生理化学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~saibou/
久保健雄教授和國枝武和教授主要分为3大板块。该研究室的重点中的重点就是通过对蜜蜂社会性行动的分子神经基础的解析，展开对大脑领域以及遗传活动的深入研究。另外，爪蟾幼生尾再生的分子机制、蝮蛇对极端环境的耐受性的分子层面的研究等也是当下该研究室的主要课题。
近期研究发表：
Iino S, Shiota Y, Nishimura M, Asada M*, Ono, M* and Kubo T*. (2020) Neural activity mapping of bumble bee (Bombus ignitus) brains during foraging flight using immediate early genes. Sci. Rep. in press.
Kumagai H†, KuniEDA T†, Nakamura K†, Matsumura Y†, Namiki M, Kohno H, Kubo T. (2020) Developmental stage-specific distribution and phosphorylation of Mblk-1, a transcription factor involved in ecdysteroid-signaling in the honey bee brain. Sci. Rep. in press.
⑤武田 洋幸 教授 / TAKEDA Hiroyuki
⑥入江 直樹 教授 / IRIE Naoki.
研究方向：動物発生学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~hassei/
武田洋幸教授和入江直樹教授（梦中情师竟在东大？）的研究室，则使用斑马鱼等小型鱼类进行对脊椎动物初期发生过程中的体轴形成、器官形成机制的分析。同时，研究室还加入了斑马鱼基因组计划的深入探讨，以促进对脊椎动物的基因组进化的研究。目前，该研究室的主要课题有体轴形成及器官形成的基本原理、演化与发生的一般关系规律的阐明以及母婴间微节律对母婴发生的影响等。
近期研究发表：
Ryohei Nakamura, Yuichi Motai, Masahiko Kumagai, Candice L. Wike, Haruyo Nishiyama, Yoichiro Nakatani, Neva C. Durand, Kaori Kondo, Takashi Kondo, Tatsuya Tsukahara, Atsuko Shimada, Bradley R. Cairns, Erez Lieberman Aiden, Shinichi Morishita, Hiroyuki TakEDA, CTCF looping is established during gastrulation in mEDAka embryos. Genome Research, 31:968-980. (2021).
Candice L. Wike, Yixuan Guo, Mengyao Tan, Ryohei Nakamura, Dana Klatt Shaw, Noelia Díaz, Aneasha F. Whittaker-Tademy, Neva C. Durand, Erez Lieberman Aiden, Juan M. Vaquerizas, David Grunwald, Hiroyuki TakEDA, Bradley R. Cairns, Chromatin architecture transitions from zebrafish sperm through early embryogenesis. Genome Research, 31:981-994. (2021).
⑦塚谷 裕一 教授 / TSUKAYA Hirokazu
研究方向：発生進化
🔗研究室链接
https://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~bionev2/
塚谷裕一教授是另一位为数不多的对植物进行展开式研究的教授。该研究室的主要关注点便是树叶的发育和进化。迄今为止，该研究室通过拟南芥确定了控制叶片形状和大小的重要基因，可以说是领先于世界其他地区。同时，在塚谷教授的带领下，更是发现了植物的补偿作用机制。目前，该研究室着重于研究调节树叶形态的遗传基因群及其控制网络、以及叶片自适应形态进化的基因背景等。
近期研究发表：
An auxin signaling network translates low-sugar-state input into compensated cell enlargement in the fugu5 cotyledonTabeta H, Watanabe S, Fukuda K, Gunji S, Asaoka M, Hirai MY, Seo M, Tsukaya H, Ferjani APLoS Genet. 2021 Aug 5;17(8):e1009674. doi: 10.1371/journal.pgen.1009674. PMID: 34351899.
Identification of the unique molecular framework of heterophylly in the amphibious plant Callitriche palustris LKoga H, Kojima M, Takebayashi Y, Sakakibara H,Tsukaya H. Plant Cell. 2021 Jul 27: koab192, https://doi.org/10.1093/plcell/koab192
⑧近藤 修 教授 / KONDO Osamu
研究方向：形態人類学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~keitai/
近藤修教授的形態人類学，其实就是通过人体骨骼以及牙齿的形态、对人类的进化、人类群体的变异以及适应能力进行展开式研究。目前，该研究室主要的研究课题有西亚尼安德特人与现代型智人的系统关系与交替、土耳其新石器时代人体的骨骼特征与墓葬、绳文人及北海道阿伊努的人类学等。
近期研究发表：
Kuwamura K. (2002) Sexual and populational difference in humeral muscle insertions between Jomon people and recent Japanese. Inter-Congress of IUAES 2002 Tokyo.
Kondo O, and Ishida H. (2003) Ontogenetic variation in the Dederiyeh Neandertal infants: Postcranial evidence. In Patterns of Growth and Development in the Genus Homo, ed. Thompson JL, Krovitz GE and Nelson AJ. Cambridge: Cambridge University Press. pp.386-411.
⑨荻原 直道 教授 / OGIHARA Naomichi
研究方向：人類進化生体力学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~ogihara/
荻原直道教授旨在从力学的角度了解人体肌肉骨骼结构的适应性，在阐明人类特有的例如直立双足和精确抓取能力等运动功能的演变的同时，也推动研究肌肉骨骼疾病的预防和治疗。该研究室的研究方法包括基于CT等医学断层图像的三维形态分析等生物力学分析、以动作捕捉系统及高速摄像机对力传感器的运动分析，以及基于肌肉骨骼模型的物理运动的计算机模拟。
近期研究发表：
Pina, M., Kikuchi, Y., Nakatsukasa, M., Nakano, Y., Kunimatsu, Y., Ogihara, N., Shimizu, D., Takano, T., Tsujikawa, H., Ishida, H.: New femoral remains of Nacholapithecus kerioi: Implications for intraspecific variation and Miocene hominoid evolution, Journal of Human Evolution, Vol.155, 102982, (2021/6)
Chen, T-Y., Kawakami, T., Ogihara, N., Hosoda, K., Free moment induced by oblique transverse tarsal joint: investigation by constructive approach, Royal Society Open Science, Vol.8, 201947, (2021/4)
⑩太田 博樹 教授 / OTA Hiroki
研究方向：ゲノム人類学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~genomeanthro/
太田博樹教授也是人类学研究的导师之一，但更多的是通过基因入手。通过从古老的生物遗迹中提取和纯化DNA，用测序仪进行测序。该研究室最新的一项成就便是绳纹人类的全基因组测序草案。此外，主要研究的课题还有古代基因组分析、少数生产族的基因组分析、以及人类和麸质食物的来源和新陈代谢相关遗传分析。
近期研究发表：
Kae Koganebuchi, Kimitoshi Sato, Kiyotaka Fujii, Toshihiro Kumabe, Kuniaki Haneji, Takashi Toma, Hajime Ishida, Keiichiro Joh, Hidenobu Soejima, Shuhei Mano, Motoyuki Ogawa, Hiroki Oota*An Analysis of the demographic history of the risk allele R4810K in RNF213 of moyamoya diseaseAnnals of Human Genetics (2021) doi:10.1111/ahg.12424
R. Schmidt*, K. Wakabayashi, D. Waku, T. Gakuhari, K. Koganebuchi, M. Ogawa, J. Karsten, M. Sokhatsky, H. Oota*Analysis of ancient human mitochondrial DNA from Verteba Cave, Ukraine: insights Into the origins and expansions of the Late Neolithic-Chalcolithic Cututeni-Tripolye Culture.Anthropological Sciences (2020) doi: 10.1537/ase.200205
⑪杉山 宗隆 教授 / SUGIYAMA Munetaka
⑫伊藤 恭子 教授 / ITO Kyoko
研究方向：生体制御
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~seigyo/
虽然杉山宗隆教授和伊藤恭子教授的研究室合并为同一个研究室，但是研究方向却各有不同。杉山宗隆教授主要负责植物器官的形成与再生等相关分子机制；而伊藤恭子教授则主要研究产生植物器官和组织模式的细胞间与细胞内的信号、以及对改变细胞发育机制基因的寻找。
近期研究发表：
Kurataka Otsuka, Akihito Mamiya, Mineko Konishi, Mamoru Nozaki, Atsuko Kinoshita, Hiroaki Tamaki, Masaki Arita, Masato Saito, Kayoko Yamamoto, Takushi Hachiya, Ko Noguchi, Takashi UEDA, Yusuke Yagi, Takehito Kobayashi, Takahiro Nakamura, Yasushi Sato, Takashi Hirayama, Munetaka Sugiyama (2021) Temperature-dependent fasciation mutants provide a link between mitochondrial RNA processing and lateral root morphogenesis. eLife. 10: e61611. (DOI 10.7554/eLife.61611)
Ohashi-Ito, K. and Fukuda, H.Transcriptional networks regulating root vascular development. Curr. Opin. Plant. Biol., 57: 118-123.
⑬寺島 一郎 教授 / TERASHIMA Ichiro
⑭小口 理一 教授 / OGUCHI Riichi
研究方向：植物生態学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~seitaipl/
由寺島一郎教授和小口理一教授组成的研究室，旨在通过对构成植物生产基础的光合系统、呼吸系统、透水性等方面的解析，从分子到个体、再到生态系统的各个层面，对植物的环境响应、环境适应等能力进行全方位的阐述，有助于在未来将要面对的高二氧化碳和变暖环境中，提高作物的生产力。研究对象主要有拟南芥等具有代表性的植物、水稻等主要作物、户外生长的木本植物和酵母等。
近期研究发表：
Kitagawa T, Matsumoto A, Terashima I, Uesono Y (2021) Antimalarial quinacrine and chloroquine lose their activity by decreasing cationic amphiphilic structure with a slight decrease in pH. Journal of Medicinal Chemistry (in press)
Funayama-Noguchi S, Shibata M, Noguchi K, Terashima I (2021) Effects of root morphology, respiration and carboxylate exudation on carbon economy in two non‐mycorrhizal lupines under phosphorus deficiency. Plant, Cell and Environment 44: 598–612.
⑮上島 励 教授 / UESHIMA Rei
研究方向：進化系統学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~keitou/lab.html
上島励教授的研究室主要以软体动物为研究对象，通过分子生物学以及线粒体DNA基因组结构分析等形态学方法，研究后生动物的进化和系统的分类。目前，该研究室的研究内容主要分为基于mtDNA基因组结构的无脊椎动物系统分析、陆产贝类的物种分化研究、以及软体动物的分类及分子系统的解析。
近期研究发表：
Ueshima, R. and Asami, T. (2003) Single gene speciation by left-right reversal. Nature 425: 679. (doi:10.1038/425679a) [Abstract and PDF]
Lydeard, O., Holznagel, W. E., Ueshima, R. and Kurabayashi, A. (2002) Systematic implications of extreme loss or reduction of mitochondrial LSU rRNA helical-loop structures in gastropods. Malacologia 44: 349-352.
⑯土松 隆志 教授 / TSUCHIMATSU Takashi
研究方向：植物進化学
🔗研究室链接
https://tsuchimatsu.wordpress.com/
土松隆志教授的研究室将“在生物中发现的各种巧妙机制和形式是如何进化的”作为研究入手点，以植物的繁衍机制为研究对象，从而分析对生命表达形状以及进化有着重要影响的基因组。目前，该研究室主要进行「基于基因组数据的植物自适应进化机制扽探究」「被子植物多种生殖系统的进化」「接合藻类中基因组结构和交配方式的进化」等课题的研究。
近期研究发表：
Kurata, S., Sakaguchi, S., Mishima, H., Tsuchimatsu, T., and Ito M. (2021) Development and characterization of nuclear microsatellite markers to reveal the neutral demographic background of flower color polymorphism in Geranium thunbergii (Geraniaceae), Genes & Genetic Systems.
Bamba, M., Aoki, S., Kajita, T., Setoguchi H., Watano, Y., Sato, S., and Tsuchimatsu, T. (2020) Massive rhizobial genomic variation associated with partner quality in Lotus–Mesorhizobium symbiosis. FEMS Microbiology Ecology 96: fiaa202.
⑰井原 泰雄 教授 / IHARA Yasuo
研究方向：進化人類学
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~shinkajin/
井原泰雄教授的强项不仅有進化人類学，还有数理生物学。他致力于通过使用数理生物学技术、来解析与人类行为进化相关的各种问题。该研究室主要是通过数学模型分析和计算机模拟等方法，加深对早期人类社会进化、人属认知进化和现代人类文化进化的每一个理解。
近期研究发表：
Takahashi T, Ihara Y.. application of a Markovian ancestral model to the temporal and spatial dynamics of cultural evolution on a population network. Theoretical Populatoin Biology (2021).
Kobayashi H, Kobori O, Ihara Y, Yaguchi H, Yasuda T.. Understanding ostensive behavior in making inferences of referential intentions. Letters on Evolutionary Behavioral Science (2021).
⑱大橋 順 教授 / OHASHI Jun
研究方向：ヒトゲノム多様性
🔗研究室链接
http://www.bs.s.u-tokyo.ac.jp/~humgendiv/
大橋順教授擅长基于囊括统计分析、数学分析等在内的理论研究、和与基因组多样性分析相关的实验的结合，分析人类进化史、基因型与表型之间的关系以及分子进化机制。当下阶段，该研究室主要对自然选择对基因组的影响、种群起源、迁移和混血过程、 传染病和人类遗传适应、以及大洋洲区域的体型和脂质代谢研究相关的多态性进行分析和研究。
近期研究发表：
Isshiki M, Naka I, Kimura R, Nishida N, Furusawa T, Natsuhara K, Yamauchi T, Nakazawa M, Ishida T, Inaoka T, Matsumura Y, Ohtsuka R, Ohashi J. 2021. Admixture with indigenous people helps local adaptation: admixture-enabled selection in Polynesians. BMC Ecology and Evolution (in press).
Isshiki M, Watanabe Y, Ohashi J. 2021. Geographic variation in the polygenic score of height in Japan. Human Genetics (in press).
知日温馨提示：
最后再唠叨一句！生物科学这门学科，对于英语文献阅读和发表能力、实验操作与设计能力、发现问题并分析解决问题的能力等均有较高的要求。特别是东大这种学霸比比皆是的bao宝藏神仙地，除了良好的日语沟通能力，英语在交流和学术论文上也是无！比！重！要！
知日塾王牌生物/药学讲师
👨🏫
于老师东京大学 基础医学 博士
哈佛大学 生物学 修士
教学经验6年+
辅导数十位学生考上东京大学等一流院校
多年辅导药学、生物相关专业的课程
从知识点到做题技巧
都总结了自己的解题技巧
热切希望能与学生们分享
于老师经验丰富、教学成绩优异
曾辅导数十位学生考上东大
东医齿等基础医学王牌名校
其耐心细致的授课风格与专业的讲解
也赢得了众多学生的喜爱
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