伊萨克二世在位时期

1185年 

塞萨洛尼卡被诺曼人攻陷，安德洛尼卡一世倒台，贵族伊萨克·安格洛斯被君堡市民拥立为帝

塞浦路斯总督伊萨克·科穆宁据塞浦路斯叛乱自立为帝

斯特利蒙河之战，诺曼人被将领阿莱克修斯·布拉纳（阿莱克修斯一世的哥哥至尊者伊萨克的外孙）击败，诺曼人支持的皇位觊觎者、曼努埃尔一世的私生子、“斟酒人”阿莱克修斯·科穆宁被生擒后刺瞎

年底，保加利亚复国叛乱爆发

1186年

因对保加利亚战事不利以及疑心病发作，伊萨克二世连续撤换约翰·杜卡斯 、约翰·坎塔库泽诺斯两员前线主帅，代之以之前击败诺曼人的宿将阿莱克修斯·布拉纳

1187年

阿莱克修斯·布拉纳于阿德里安堡拥军反叛自立为帝、向君士坦丁堡进军，后于君士坦丁堡城外被凯撒康拉德阵斩，叛乱平定

1188年-1189年

菲拉德尔菲亚执政官狄奥多尔·曼加法斯（Mangaphas）自立为帝，伊萨克二世亲自率军讨伐、不能取胜，最终伊萨克二世承认狄奥多尔·曼加法斯在菲城的统治，而狄奥多尔·曼加法斯自去帝号

期间，第三次十字军东征，拜占庭军队于阿德里安堡遭遇惨败

1190年

贵族君士坦丁·泰提修斯（Tatikios）于君士坦丁堡谋叛，事泄，为伊萨克二世刺瞎：

将领君士坦丁·阿斯庇特斯（Aspietes）在马其顿平叛期间，因向士兵私自发放被拖欠的军饷，伊萨克二世认为其收买军心、企图谋反、将其逮捕刺瞎：

将领卓特扎斯（Chotzas）于塔尔西亚发动叛乱并脱离帝国

1192年

一名来自君堡的年轻人自称阿莱克修斯二世，其来到科尼亚，向罗姆苏丹基利杰·阿尔斯兰借8000突厥兵进入门德雷斯河谷劫掠、并攻陷歌罗西（Chonae），至尊者阿莱克修斯（后来的阿莱克修斯三世）率军抵御但不能获胜，后此人因侵犯教堂为当地神父刺杀：

同年，又一年轻人亦自称阿莱克修斯二世，于帕夫拉戈尼亚起兵并获得当地人的支持，后被击败处决：

将军、伊萨克二世的堂弟君士坦丁·安格洛斯在对抗保加利亚人的前线发动叛乱自立为帝，但旋及在阿德里安堡附近遭到部将出卖被捕，伊萨克二世将其刺瞎

1193年年底

阿卡迪波利斯之战，拜占庭军全军覆没，主将巴西尔·瓦塔泽斯阵亡、另一员主帅阿莱克修斯·吉多斯单骑逃命，保加利亚趁势攻陷菲利普波利斯，将疆域扩展到色雷斯

1195年

马其顿总督、至尊者约翰·佩特拉里法斯与将领狄奥多尔·布拉纳、米海尔·坎塔库泽诺斯等人合谋，趁伊萨克二世离开军营行猎之机，于大营策动兵变，拥立伊萨克二世之兄阿莱克修斯·安格洛斯为帝，为阿莱克修斯三世，伊萨克二世出逃途中被捕，遭到刺瞎监禁

阿莱克修斯三世时期

1196年

又一人在尼科米底亚自称阿莱克修斯二世发动叛乱，失败被擒后刺瞎

1198年-1200年

色雷斯地方长官保加利亚人伊万科叛乱，于巴特昆战役击败曼努埃尔·卡米泽斯所统帅的拜占庭军队。直到1200年，阿莱克修斯三世以诡计将其诱捕囚死

1199年

贵族米海尔·坎塔库泽诺斯反抗阿莱克修斯三世统治

1200年-1204年

莫奈姆瓦夏地方豪强利奥·夏马雷托斯（Leo Chamaretos）于拉科尼亚建立独立政权，后接受阿莱克修斯三世招安，君堡朝廷授予其“至尊者”荣衔，名义上臣属安格洛斯王朝：

纳夫普里翁执政官利奥·斯古洛斯发动叛乱，连克阿尔戈斯和科林斯，并劫掠雅典周边，又公然致残并杀害当地三名主教，君士坦丁堡朝廷派遣将领迈克尔·斯特里夫诺斯（Michael Stryphnos）平叛，但不能取胜，直至第四次十字军君士坦丁堡沦陷，利奥·斯古洛斯一直牢牢掌控纳夫普里翁和科林斯周边地区、而君堡朝廷奈何不得，事实上从拜占庭帝国分裂出去

1201年

阿莱克修斯三世的表亲曼努埃尔·卡米泽斯与保加利亚贵族多布罗米尔·克里索斯联手，分别于塞萨利和马其顿发动叛乱，叛军切断了君士坦丁堡与希腊南部的联系，导致塞萨利以南地方分离势力昌炽。后多布罗米尔的领地被保加利亚人夺取；

斯莫雷纳总督斯皮里多纳克斯（Spyridonakes）于马其顿东部发动叛乱，阿莱克修斯三世派遣女婿阿莱克修斯·巴列奥略平定叛乱，斯皮里多纳克斯逃亡保加利亚；

梅拉萨总督米海尔·杜卡斯发动叛乱，后被镇压，米海尔逃往罗姆苏丹国；

首都君士坦丁堡发生暴乱，约翰二世的曾孙约翰·科穆宁（约翰二世长子共治皇帝阿莱克修斯之孙，绰号“肥仔”）被君士坦丁堡市民推举为帝，并一度占据大皇宫，阿莱克修斯三世于布拉切奈宫指挥平叛，最终依靠瓦兰吉卫队平定叛乱，约翰被捕处死

1202年-1204年

伊萨克二世之子阿莱克修斯逃出君士坦丁堡来到姐夫施瓦本的菲利普处避难，针对君士坦丁堡的第四次十字军正在酝酿