转录组测序是对特定发育阶段或生理条件下细胞内的完整mRNA进行测序。转录组测序对从整体水平上研究基因的表达量以及基因结构提供帮助,揭示特定生物学过程中的分子机理。已广泛应用于基础研究、临床诊断、药物研发和分子育种等各个领域。真核有参转录组测序,指对已有参考基因组的真核生物或其组织、细胞等进行转录组测序。通过与参考基因组比对,可验证转录组测序的测序饱和度和基因覆盖度,同时可获得基因结构、基因表达差异,和可变剪接等信息。