什么？只做公共数据库分析就能发到10分+ 1区Top文章？SEER数据库就能做到！发文周期相

2023-04-12 19:00 作者:尔云间 0人读过 | 我要投稿

小云前面提到：想要突破生信内卷，可以从临床出发找新出路

主要包括3类：1）从一些临床问题入手

2）利用一些临床数据库做分析

3）拉上临床试验，做成临床+基础研究类开拓性新思路

第1和3条路小云都给朋友们分享过相关思路，感兴趣的小伙伴可点击文末链接或公众号搜索观看哦

咱们这回从第2条——临床数据库入手，临床公共数据库也有很多，常用的、发文量比较多的比如SEER、NHANES数据库等，分析不难，并且又比较容易发高分，实在是个不可多得的发文好途径呀~ ~

先介绍一下SEER数据库！（NHANES数据库后面介绍相关分析文章，敬请期待哦）

p 什么是SEER数据？

SEER数据库（Surveillance, Epidemiology, and End Results Program），是美国国家癌症研究所监测，流行病学和最终结果数据库，是临床常用的公共数据库之一。它收录了大量的临床肿瘤回顾性研究资料，数据获取便捷并且公开免费，以SEER数据库为数据来源的SCI文章正逐年增长。网址：

https://seer.cancer.gov/SEER

p SEER数据库内容

SEER数据库涵盖了9大类部位肿瘤：乳腺肿瘤、结肠与直肠肿瘤、其他消化系统肿瘤、女性生殖系统肿瘤、淋巴系统肿瘤与血液系统肿瘤、男性生殖肿瘤、呼吸系统肿瘤、泌尿系统肿瘤及其他尚未确定的类型（最大的四个癌症组是肺癌，结肠癌/直肠癌，乳腺癌和前列腺癌）。数据记录中包括患者的注册编号、个人信息、原发病灶部位、肿瘤尺寸、肿瘤编码、治疗方案、死亡原因等信息。SEER提交的数据将在每年的十一月进行检查，在第二年的四月中旬开放注册。

今天以一个10分+的SEER数据库分析文章给小伙伴们打个样，看看如何只用一个数据库做些分析就发高分，对于临床研究者相当适合、发文周期也比较快，感兴趣的朋友抓紧学起来啦！

l 题目：辅助紫杉烷加蒽环类药物与紫杉烷为基础的化疗方案治疗老年淋巴结阳性、三阴性乳腺癌的临床结果对比：一项SEER-Medicare研究

l 杂志：European Journal of Cancer.

l 影响因子：IF=10.002

l 发表时间：2023年2月

研究背景

三阴性乳腺癌(TNBC)是一种与侵袭性临床过程相关的乳腺癌亚型。辅助化疗降低了淋巴结阳性TNBC患者的复发风险并提高了生存率。在患有淋巴结阳性TNBC的老年妇女中，蒽环类药物加紫杉类药物(ATAX)方案与不含蒽环类药物、基于紫杉类药物的方案(TAX)相比，其益处尚不明确。

研究思路

使用SEER数据库，收集在2010年至2015年间的1106名年龄在66岁及以上的诊断为淋巴结阳性TNBC的女性患者数据。根据辅助化疗方案比较了患者的临床特征(化疗与不化疗，ATAX与TAX)。逻辑回归来估计优势比(OR)和95%置信区间(CIs)。Kaplan-Meier生存曲线用于估计3年总生存率(OS)和癌症特异性生存率(CSS)。在控制患者和肿瘤特征的情况下，采用Cox比例风险模型来分析OS和CSS。

主要结果

1. 患者基线特征

2010年至2015年间的1106名年龄在66岁及以上的诊断为淋巴结阳性TNBC的女性患者被纳入队列分析，患者基线特征见表1。

表1 患者基线特征

2. 与使用辅助化疗有关的因素分析

Logistic回归分析对化疗与未化疗、含紫杉烷+蒽环类药物方案与含紫杉烷方案的变量（包括患者基本特征、肿瘤大小和淋巴结状态和医学共病）进行OR估计（表2）。分析显示，与66-70岁的患者相比，年龄≥76岁的患者接受辅助化疗、接受ATAX与TAX治疗的可能性较低。在接受以紫杉烷为基础的化疗方案的患者中，有4个或更多阳性淋巴结的患者比有1-3个阳性淋巴结的患者更有可能接受ATAX治疗(OR 1.63，95% CI:1.13-2.37，P < 0.01)。与没有心力衰竭的患者相比，先前诊断为心力衰竭的患者接受辅助化疗的可能性更低，然而，在接受辅助化疗的既往心力衰竭患者中，接受ATAX与TAX的比例没有显著差异。（ps：逻辑回归分析也可以用小云新开发的零代码生信分析小工具实现，云生信分析工具平台包含超多零代码分析和绘图小工具，上传数据一键出图，感兴趣的小伙伴欢迎来尝试哟，网址：http://www.biocloudservice.com/home.html）。

表2 与使用辅助化疗有关因素的逻辑回归分析

3. 化疗类型与生存期分析

Kaplan-Meier生存曲线用于估计接受化疗与未接受化疗患者、接受ATAX与TAX化疗患者的3年总生存率(OS)和癌症特异性生存率(CSS)。结果显示，化疗显著改善了CSS和OS（图1A, B）。对于接受含紫杉烷方案的患者，接受ATAX的患者与接受TAX的患者相比，在CSS或OS方面没有差异（图1C, D）。在有四个或更多淋巴结的患者中，与TAX相比，ATAX有改善CSS和OS的趋势(图1G–H)。

图1 化疗类型与生存期分析

4. 控制协变量的CSS和OS的分析

在控制患者和肿瘤特征等协变量的情况下，采用多变量Cox风险模型来分析OS和CSS，并绘制森林图。结果显示，与TAX相比，ATAX并没有改善CSS。然而，当按年龄和阳性淋巴结数目分层时，CSS中出现了一种特定的趋势——与TAX相比，接受ATAX治疗的年龄大于等于76岁且有4个或更多阳性淋巴结的老年患者的CSS有所改善； ATAX治疗的老年患者淋巴结受累较少，有1-3个阳性淋巴结，CSS有减少的趋势（图2）。OS的趋势与CSS趋势相似（图3）。