计算机辅助药物设计工具目录2

化学结构表示

ChemDraw， MarvinSketch， ACD / ChemSketch， jsMolEditor， Marvinmoleculeeditorandviewer， Ketcher， UCSFChimera， Pymol， OpenStructure， DaylightSMILES， InChI， TriposMol2， OpenBabel， Corina， Indigo， PoseView， PLiP， Ligplot +， E-Babel， Corinaonlinedemo， ChemicalIdentifierResolver， COSMOS， VEGAWE， PDB氢加成， DG-AMMOS， ChemMobi， ChemSpotlight，...

分子模拟

CHARMM， GROMACS， 琥珀， SwissParam， CHARMM-GUI， CHARMMing.org，...

同源建模

建模器， I-TASSER， LOMETS， SWISS-MODEL， SWISS- MODEL 存储库， Robetta，...

结合位点预测

MED-SuMo， TRAPP， CAVER， sc-PDB， CASTp， Pocketome， 3DLigandSite， metaPocket， PockDrug，...

对接

Autodock， DOCK， GOLD， SwissDock， DockingServer， 1-ClickDocking，...

筛选

Pharmer， 催化剂， PharmaGist， SwissSimilarity， Blaster， AnchorQuery，...

目标预测

PatchSearch， IXCHEL， CABRAKAN， SwissTargetPrediction， SEA， CSNAP，...

配体设计

甘地， LUDI， 犬种， SwissBioisostere， VAMMPIRE， SC-PDB-破片， 电子LEA3D， eDesign， iScreen，...

结合自由能估算

海德， X分数， NNScore， DSX 在线， BAPPLserver， BAPPL-Zserver， CLiBE，...

QSAR

cQSAR， SeeSAR， 的clogP， MOLEdb， ChemDB /数据集， DatasetsfromtheMilanoChemometricsandQSARResearchGroup， OCHEM， E-龙， PatternMatchCounter，...

ADME毒性

QikProp， VolSurf， GastroPlus， ALOGPS， OSIRISPropertyExplorer， SwissADME， PACT-F， TOXNET， LeadscopeToxicityDatabase，...