[菜鸟博士学习] Image J操作:WB定量和划痕实验距离测定
Image J操作:WB定量和划痕实验距离测定
01、Image J介绍①菜单栏:文件(File),编辑(Edit),图形(Image),处理(Process),分析(Analyze),插件(Plugins),窗口(Windows),帮助(Help)。②工具栏:可编辑文件的大小、标记、测量、填充等。③状态栏:正在处理文件的状态、大小、单位等显示。

工具栏介绍:

02、WB操作步骤一、WB数值化方法灰度分析(Band density)计算机图像分析仪根据图像颜色深浅分为256个级别。灰度值越小物体颜色越深
光密度分析光线通过溶液(物质)前的入射光强度与该光线通过溶液(物质)后的透射光强度比值的对数。光密度值越大,物体颜色越深,阳性物质相对含量越大。
二、操作步骤导入/打开:File→Open(Ctrl+O)→ 弹出对话框→选择文件夹→找到WB条带。

Tips:直接将需要分析的图片拖入【状态栏】
转化灰度图:
①Image→Type→8-bit

②Process→Subtract Background(Rolling ball radius默认50),勾选【Light background】


设置定量参数:③Analyze→Set Measurements

④进行需要观察结果项的勾选

设置单位:⑤Analyze→Set Scale

⑥Unit of length→【Pixels】

转换亮度:[Edit] → Invert

选择条带:【工具栏】——区域选择工具。选择分析的单个条带

分析:【Anlyze】——选项

结果分析:

对应:对应研究基因和内参的IntDen,以研究基因/内参基因。

03、划痕距离测定一、标尺校正不进行标尺校正,得到的长度单位为pixel(像素),面积单位为平方像素(pixel2)。

1、打开一张带有标尺的图片;2、选择直线工具,在标尺上沿着标尺画一条直线。

3、点击【Analyze】→Set Scale;

4、点击Click to Remove Scale;Known distance填250μm;Unit of length填入单位(μm);选择Global为对之后打开的图片都有效(必选项)。
二、面积检测方法划痕距离测量为等效测量划痕宽度平均值=划痕空隙面积/长度。细胞迁移率=(0h划痕宽度-培养后划痕宽度)/0h划痕宽度×100%。

转化灰度图:Image→Type→8-bit

增强对比:1、点击【Process】→【enhance contrast】;2、【Saturated pixels】中选择0.3,默认Normalize;3、点击【OK】


平滑边缘:Process→Smooth(Ctrl+shift+S)

寻找边缘:Process→Find Edges

阈值设定:【Image】→Adjust→Threshold(Ctrl+shift+T)

设置和选择:1、选中为红色,调节阈值为0-20。点击【Apply】

2、选择【工具栏】中的魔棒工具,在划痕面积处点击。

3、弹出的Wand Tool中的【Tolerance】选择2,点击OK。4、【Anlyze】-Measure

【供学习交流使用】