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记录一次用lme4(R包)计算广义遗传力

2023-08-21 21:34 作者:Albert_Xin  | 我要投稿

广义遗传力是指遗传变异占总变异的百分数,遗传方差占表型方差的百分数用H表示,这里我使用一年多点的数据进行演示,这里我们考虑环境编译。

数据准备:第一列为品种名,第二列为重复的编号,第三列为环境因子,第四列为表型

数据准备

lme4安装

遗传力计算公式

遗传力计算公式

其中,Vg表示表遗传方差,Vge表示基因环境互作变异,L表示环境个数,Ve表示环境变异,R表示重复次数。

请将head改为图中所示的head,然后后使用如下r脚本进行计算。

方表示,这里我使用一年多点的数据进行演示,这里我们考虑环境编译。

数据准备:第一列为品种名,第二列为重复的编号,第三列为环境因子,第四列为表型

数据准备

lme4安装

遗传力计算公式

遗传力计算公式

其中,Vg表示表遗传方差,Vge表示基因环境互作变异,L表示环境个数,Ve表示环境变异,R表示重复次数。

请将head改为图中所示的head,然后后使用如下r脚本进行计算。

然后我们就可以看见遗传力了

计算结果


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