记录一次用lme4(R包)计算广义遗传力
2023-08-21 21:34 作者:Albert_Xin | 我要投稿
广义遗传力是指遗传变异占总变异的百分数,遗传方差占表型方差的百分数用H方表示,这里我使用一年多点的数据进行演示,这里我们考虑环境编译。

数据准备:第一列为品种名,第二列为重复的编号,第三列为环境因子,第四列为表型

lme4安装
遗传力计算公式

其中,Vg表示表遗传方差,Vge表示基因环境互作变异,L表示环境个数,Ve表示环境变异,R表示重复次数。

请将head改为图中所示的head,然后后使用如下r脚本进行计算。
方表示,这里我使用一年多点的数据进行演示,这里我们考虑环境编译。数据准备:第一列为品种名,第二列为重复的编号,第三列为环境因子,第四列为表型
数据准备 lme4安装
遗传力计算公式
遗传力计算公式 其中,Vg表示表遗传方差,Vge表示基因环境互作变异,L表示环境个数,Ve表示环境变异,R表示重复次数。
请将head改为图中所示的head,然后后使用如下r脚本进行计算。
然后我们就可以看见遗传力了
计算结果