iRegulon 转录因子motif 调控分析 Cytoscape

Input: 差异基因list.txt， 支持物种： 人、小鼠、果蝇

1，将数据导入Cytoscape

2, 对导入的基因list 进行设置，避免第一行基因默认为题头

3，选择source node 并点击确定

4，导入后数据如下

5，全部选中后进行分析

6，选择对应的物种

7，结果会在右侧显示出来

8，可视化调整

参考致谢： Liulab Workshop(33) 用iRegulon进行主转录因子的预测_哔哩哔哩_bilibili