来源：投稿 作者：Frank

编辑：学姐

Frank

课程研发部老师

BAT算法工程师..多次获得天池top10

赛题分析+baseline

1、赛题链接

kaggle-Hubmap分割多器官FTU

https://www.kaggle.com/competitions/hubmap-organ-segmentation/overview

2、赛题描述

之前的Kaggle竞赛旨在注释执行器官主要生理功能的细胞群体邻域，也称为功能组织单元（FTU）。

手动注释FTU（例如肾脏中的肾小球或肺中的肺泡）是一个耗时的过程。

在平均肾脏中，有100多万个肾小球FTU。虽然存在现有的细胞和FTU分割方法，但我们希望通过构建跨不同器官通用且在不同数据集差异中具有鲁棒性的算法来推动边界。

在本次比赛中，您将识别并分割五个人体器官的功能组织单元（FTU）。您将使用组织切片图像数据集构建模型，并尽可能准确地分割FTU。

※ 比赛时间线

• 2022 6月 22日 年 - 开始日期。

• 2022 9月 15 日 年 - 报名截止日期。您必须在此日期之前接受比赛规则才能参加比赛。

• 2022 9 月 15 日 年 - 团队合并截止日期。这是参与者可以加入或合并团队的最后一天。

• 2022 9 月 22 日 年 - 最终提交截止日期。

※ 丰厚的奖金

• 一等奖：15,000美元

• 二等奖：10,000美元

• 三等奖：5,000美元

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3、数据EDA

训练数据一览：

4、baseline

本次提供的baseline分为hypre-parameter,  data,  model,  Loss,  train五个方面.

整套baseline的代码非常清晰, 非常适合入门以及后续代码复用。

以下代码节选片段：

5、评价指标

Dice coefficient

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6、Trick

• 数据增强：多分辨率训练、elastictransformer等

• 模型：高级模型，Unet的一系列变体

• Loss：系数自动学习策略

• 提交：多模型混合等…